介绍土壤生态土壤生物间存在着复杂的相互作用。除植物和各种动物组成的食物链外，还有着各种共生或拮抗的关系。豆科植物根系与根瘤菌之间的共生关系是大家熟知的。根瘤菌固定空气中的氮，保证了宿主植物的氮素营养，而宿主植物则为根瘤菌提供了良好的生存环境（见微生物生态）。土壤生物间的拮抗作用更为普遍。微生物间存在抗生关系，一种微生物借分泌一种化学物质(抗生素)来抑制其他微生物的生长。20世纪60年代以来，人们发现了越来越多的高等植物借化学物质影响其他生物的事例。在上述根瘤的例子中，根同土壤内的根瘤菌便是在豆科植根分泌的物质刺激下生长和繁殖的。此外,高等植物的代谢与动物很不相同,除了蛋白质、核酸、糖、脂肪等普遍存在并具有重要生理功能的化学物质外，还制造出上万种所谓次生代谢产物，如生物碱、萜类和黄酮类化合物。这些化合物大多没有明显的生理功能，但却能抑制某些邻近植物和微生物的生长，或驱避吃食它们的动物。从而造成它们之间的一定的均势状态（见生物种间化学交互作用）。
严格说来，土壤及其中的生物并不构成一个完备的生态系统。有机物的初级生产主要由植物的地上部分完成，捕食食物链也大部在地上进行，土壤中存在的主要是腐生食物链，以分解过程为主（见生态系统）。因此在谈到森林生态系统、草原生态系统和农田生态系统时，各该地区的土壤只是相应系统的一部分,一个亚系统。在上述3类生态系统中,地上和地下部分之间物质和能量流动的情况很不相同。一般说,森林的生物生产量最大,而以凋落物形式归还土壤的物质常达1／4。草原的生产量较低，但在无放牧的情况下，凋落物却最多，可达1／2。农作物的凋落物量最少且因生产量不同而异，故需用化肥与粪肥等予以补充。
影响人类活动对土壤生态产生极大影响。过度采伐森林，可使其转化为草甸或草原。无论森林或草原，如果被开垦为农田，则土壤容易因失去植被保护而受水蚀或风蚀，如果只种植而不养护，不注意补充营养物质，土壤肥力会迅速下降。自20世纪下半叶以来，工矿与农药污染对土壤又造成了新的威胁。几千年来生活废弃物含有很多有机质与营养物质，施入土壤后可培育土壤肥力，但工矿废物却含有大量毒物，很多还是土壤微生物难以或根本不能降解的，由此可以造成土壤污染使生物死亡，被污染的生物产品与水经食用后可影响人畜健康。人类活动亦可不断改善土壤肥力使作物产量不断提高，例如亚洲人民长期培育的水稻田在良好的管理下可以保持长期稳产高产。
