医院宗旨本着耶稣基督爱人如己的心，提供优质的全人关怀与医疗照护。
任务目标医疗：以病人为中心，提供最佳服务。
传道：分享基督的爱，推展医疗传道。
教学：全面提升品质，发展教学研究。
关怀：关心社区需求，建构照顾网络。
策略方针以病人为中心的全人照顾。
提供整合性持续性的医疗。
建立合作的医疗照护团队。
提升效率掌握成本的营运。
以育才为永续发展的动力。
特色嘉基医院属于教会医院，其宗旨为在推展医疗传道，因此分别于1996年成立泰劳福音中心、1997年成立菲劳福音中心。
医疗奉献【医疗奉献奖】 医疗奉献无私藏─嘉基精神永传扬 1996年嘉基创院院长戴德森医师，荣获第六届医疗奉献奖，接续院长职务的翁瑞亨医师、陈博宪医师，于2006年、2007年更先后荣获第十六、十七届医疗奉献奖，让这美好的传承成为医界美谈。
第六届医疗奉献奖“爱在吾土吾乡”‧回应耶稣感动与呼召的戴德森医师 戴德森医师以行动回应耶稣舍己奉献爱人如己的心，贡献生命中最精华的二十五年给台湾人，1981年光荣退休时，则慨然捐出董事会馈赠的一百万元奖金，成立戴德森基金会，藉以培养更多优秀医护人员造福人群，具体展现无私的奉献之心。 1996年当戴德森医师77岁之际，因他一生为台湾默默奉献爱心，荣获第六届医疗奉献奖并返台接受颁奖，嘉基为庆贺创院院长获此殊荣，特别组成致敬团，包括医院同工及曾受戴医师照顾的患者，一同乘坐游览车陪戴德森医师前往领奖，而当戴德森医师上台领奖时，嘉义乡亲更全部起立鼓掌历久不歇。
第十六届医疗奉献奖“温暖的依靠”‧实践耶稣怜悯与医治的翁瑞亨医师 自台大医学院毕业后，因受到许多宣教士及长辈影响，本着基督教信仰的呼召，展开偏远地区的医疗服务，先后历任恒春基督教医院、屏东基督教医院长等职，默默投入南台湾的乡村医疗工作，1987年翁瑞亨怀着奉献的心，出任嘉基院长，那时嘉基只有简单的医疗设备，以及不足的医疗人员，但在翁瑞亨的带领下，嘉基逐日发展并成为嘉云地区第一家区域教学医院。 翁瑞亨医师担任嘉基院长期间，除带领医疗团队发展高科技的医疗服务，提高嘉义地区医疗水平外，更全力支援偏远山区、沿海乡镇医疗业务，成立居家服务中心推展嘉义地区独居老人居家、送餐服务，成立发展迟缓儿童早期疗育通报转介中心，协助发展迟缓儿获得良好的疗育机会。 秉持着“医疗、传道、教学、关怀”的服务宗旨，翁瑞亨医师带领嘉基迈向一个新纪元，卸下院长职务后，2001年获卫生署延揽出任保健处长(后改制为国民健康局，担任局长一职)，一再强调“健康知识、观念最重要”的他，转换跑道后仍本着医者父母心的态度，展开国民健康访查、设置区域性癌症防治中心、戒烟专线、改善妇女亲善就医环境，致力推动卫生教育的脚步未曾停歇。 而在放下手术刀、卸下官职后，翁瑞亨秉持着医师人道关怀精神，“转行”改当起全职的神学院学生，潜心于神的教诲，毕业后返回嘉基担任院牧部主任一职，为医疗传道默默付出心力，同时延续他过去前往老挝、缅甸、越南、印尼等国义诊的作为，率领嘉基海外医疗队，远赴菲律宾吕宋岛最南端的苏素银省进行义诊宣教，无私的奉献让他2006年获得第十六届医疗奉献奖，也是接续戴德森医师后，嘉基第二位获此殊荣的医师。
第十七届医疗奉献奖“恒久的爱”‧延续耶稣舍己与关怀的陈博宪医师1971年小儿科陈博宪医师从台北医学院毕业后，因深感城乡医疗资源差距甚大，毅然决定回到嘉云南地区，从最基层的住院医师做起，1975年间与美国宣教士─倪安华医师，共同建立小儿科完整医疗照护制度。 为了让云嘉南地区小孩得到适切的照护，陈博宪医师更着手儿科卫教门诊，大力推动小儿预防注射制度，预防小儿麻痹、白喉、百日咳、麻疹、德国麻疹、结核病等流行疾病，而当遇到因经济关系而无法接受治疗的病童时，陈博宪医师常会在病历上注明不收费用或打折，病童所付不足的费用，从他的薪资中扣除。 截至2008年，陈医师已服务嘉基37年，继续传承无私奉献的脚踪，让他继嘉基创院院长戴德森医师、翁瑞亨医师之后，获得第十七届医疗奉献奖，也成为嘉基第三位获得医疗奉献奖最高荣誉的医师。
大事纪大事记 （ Chronicle of Events ）
财团法人嘉义基督教医院-1957 年 7 月，美籍宣教士 戴德森 医师夫妇（ Dr. Marcy Ditmanson and Mrs. JoyceStranks Ditmanson ）应“美国信义会海外宣道部”之差派，前来台湾策划医疗布道事工。
财团法人嘉义基督教医院-1958 年 6 月， 戴德森 医师夫妇从花莲迁居嘉义。
8 月，在自宅开始诊疗工作，并购德制小型巴士在乡村及阿里山山地巡回医疗。
财团法人嘉义基督教医院-1961 年 3 月，于现今台斗坑兴建门房及仓库，命名为“嘉义信义会诊所”。
财团法人嘉义基督教医院-1962 年 4 月，兴建完成三十张病床之医院，更名为“嘉义基督教医院”。
财团法人嘉义基督教医院-1967 年 9 月，“小儿麻痹中心”成立，共有病床 100 床。
财团法人嘉义基督教医院-1975 年 外科医疗大楼落成，共有 135 床，并结束国外援助经费，成为国人自给自足之医院。
财团法人嘉义基督教医院-1985 年 10 月，综合大楼落成，共有病床 218 床。
财团法人嘉义基督教医院-1988 年 4 月，获得卫生署及教育部评鉴为“地区教学医院”。
财团法人嘉义基督教医院-1991 年 5 月，通过区域教学医院之评鉴，成为嘉云地区第一所区域教学医院。
10 月，动工兴建“戴德森纪念大楼”，病床规模达到 410 床。
财团法人嘉义基督教医院-1994 年 5 月，第二次通过卫生署区域教学医院评鉴。
5 月，成立云嘉第一个“生殖科技研究室”。
财团法人嘉义基督教医院-1995 年 9 月，成立云嘉地区第一座“心脏血管中心”。
财团法人嘉义基督教医院-1996 年 1 月，成立宣教部，专责推广国内外医疗宣教事工。
2 月，戴德森 医师荣获“中华民国第六届医疗奉献奖”。
财团法人嘉义基督教医院-1997 年 5 月，第三次通过卫生署区域教学医院评鉴，规模云嘉最大。
财团法人嘉义基督教医院-1998 年 前院长翁瑞亨获颁行政院卫生奖章。
开始着手逐步建构“癌症治疗中心”各相关专科。
12 月，“医学影像中心”成立，云嘉第一台直线加速器开始启用，并设置 Mini-PACS 。
财团法人嘉义基督教医院-1999 年 5 月， A 栋住院大楼完工，全院床数增加至 800 床。
7 月，“第一门诊中心”正式启用。
8 月，云嘉首例肾脏移植成功。
9 月，成立护理之家。
10 月，云嘉地区首例骨髓移植成功，并于 12 月完成第二例。
12 月，获行政院内政部补助计划，开始推展嘉义县市独居老人居家服务工作。
财团法人嘉义基督教医院-2000 年 陆续成立“皮肤医学美容中心”、“烧伤中心”、“高压氧治疗中心”、“整形医学美容中心”、“核子医学科”。
3 月，受嘉义县市政府委托办理“发展迟缓儿早期疗育中心”。
5 月，通过卫生署区域教学医院乙类评鉴，为云嘉规模最大之教学医院。
6 月，前院长翁瑞亨卸任，由现任院长陈诚仁担任院长一职。翁瑞亨院长并于2001 年 3 月转任为行政院卫生署保健处处长，2001 年 7 月担任首任卫生署国民健康局局长。
6 月，创院院长戴德森医师在美国逝世，享年 81 岁。
财团法人嘉义基督教医院-2001 年 戴德森文教基金会荣获原住民部落及离岛社区健康营造评比冠军。
获行政院卫生署国民健康局补助成立“南区癌症防治中心”、“南区青少年保健中心”、“南区视力保健中心”。
10 月，新医疗大楼落成，全院总床数达 1000 床，员工近 2000 人。
12 月，获行政院原住民委员会颁发“促进原住民发展有功非原住民团体奖”。
荣获第一届“部落健康营造评比”全省第一名。
财团法人嘉义基督教医院-2002 年 获行政院卫生署举办“原住民部落及离岛地区社区健康营造”评选“优等”。
获行政院卫生署“山地离岛及原住民地区护理人员贡献奖”。
3 月，成立星爱儿童发展中心，开办嘉云地区第一个也是唯一的“自闭症儿童日间病房” 。
4 月，成立全台第一个“照顾住宅”。
10 月， 荣获法务部颁发“推展犯罪被害人保护工作有功团体奖”。
11 月， 主办“第九届台日韩教会医院高阶主管会议”，就“教会医院与社区医疗服务工作及外展工作的现况与展望”进行分享与讨论。
12 月，完成云嘉首例活体肾脏移植。
财团法人嘉义基督教医院-2003 年 响应卫生署推动“家庭医师整合性照顾计划”，结合基层诊所医师，提供社区民众就医、转诊，转检所需的持续性医疗照护。
1 月，嘉基志工队获选全国绩优团队。
3-6 月，SARS（严重急性呼吸综合症）期间，本院全体员工齐心对抗疫情，并获卫生署肯定。
4 月，与国立嘉义大学合作推动医疗专业课程。
5 月，通过卫生署区域教学医院乙类评鉴，为云嘉规模最大之教学医院。
6 月，嘉义县居家服务中心开办老人日间照顾。
7 月，与地区医疗诊所连线 家庭 医师整合性照护制度上路。
12 月，早期疗育中心成立嘉义地区山线服务处。
12 月，承接嘉义市政府委托开办嘉义市身心障碍综合园区 -- 再耕园开幕。
财团法人嘉义基督教医院-2004 年 1 月，接受卫生署疾病管制局委托，成为嘉义地区传染病专责医院之支援医院。
2 月，建构 PACS 系统，全院无片化时代来临。
3 月， 正式成立医师教育小组每季定期进行同理心沟通技巧、医疗伦理、病人安全相关课程，并有问卷分析作为改进之参考。
3 月， 主办台湾教会医院协会年会，就“建构安全的教会医院”进行反省与学习。
3 月，获行政院劳委会重视女性人力资源优良事业单位评鉴唯一获奖医疗院所。
3 月，获卫生署国民健康局委托于阿里山乡南三村推动全国首创 “安全社区营造”。
6 月，电脑会诊系统上线，使用手机短信通知医师会诊，会诊资讯不漏接。
10 月，荣获经济部节约能源绩优厂商优等奖。
10 月， 主办“CCMM 路加传道会全国医务人员退修会”，共同学习以耶稣基督的爱来从事医疗传道及社会关怀工作。
12 月，嘉基社区医疗群荣获医策会颁发参予“社区医疗品质提升先导计划”最佳合作伙伴。
12 月，护理之家荣获行政院卫生署全国护理之家访查“优等奖”。
12 月，获卫生署及台湾医务管理学会联合认证为“双语亲善医院”。
12 月，网站获卫生署评选为优良健康资讯网站。
12 月，荣获行政院卫生署国民健康局“全国烟害防制优良职场”绩优执行奖。
财团法人嘉义基督教医院-2005 年 1 月，南亚海啸，嘉基救灾医疗团前往印尼灾区进行医疗救援。
1 月，完成第七例肾脏移植手术。
3 月，本院在屏东县大同国小车祸事件中，大量伤患处理能力获肯定。
8 月，实验诊断科通过中华民国实验室认证体系 (CNLA) 医学领域认证。
10 月，阿里山安全社区荣获世界卫生组织（ WHO ）认证。
10 月，承办全国老人日托博览会。
10 月，接受卫生署及外交部的托付，与菲律宾苏素银省立医院缔结姊妹医院 ，传递医疗关怀成为落后地区的医疗顾问团。
10 月，荣获行政院卫生署及台湾妇产科医学会共同颁发“母婴亲善医院认证”。
11 月，积极 投入子宫颈抹片筛检，获嘉义市政府表扬“功在妇癌”。
11 月，于嘉义市西区成立“经国老人综合服务中心”。
12 月，再耕园荣获行政院公共工程委员第四届金擘奖优等奖。
12 月，癌症防治中心获得行政院卫生署国民健康局审定为 A 级补助。
12 月，获卫生署国合处 表扬参与“拓展国际卫生外交，推动国际合作卫生医疗计划”、“医疗器材援助平台计划”。
财团法人嘉义基督教医院-2006 年 2 月， 购置全数位式乳房摄影及穿刺定位系统X光机、 全身扇形光束骨质密度测定仪 ， 全面提升医疗设备，提供病患优质医疗服务。
3 月， 翁瑞亨医师荣获“中华民国第十六届医疗奉献奖”， 并再度获颁行政院卫生奖章。
9月， 购置正子电脑断层扫描仪（PET/CT），提升医疗设备，提供云嘉南地区癌症病患优质医疗服务，以达“早期发现、早期治疗”之目的。
10月，本院荣获中华民国第六届国家公益奖 用心医疗。
11月，嘉义基督教医院网站荣获行政院卫生署评选为“九十五年度优良健康资讯网站”。
11月，本院获行政院卫生署“优良无烟职场”表扬。
11月，本院获得卫生署评定为全国医疗院所减废绩优单位 。
11月，本院西城社区健康营造中心 荣获行政院卫生署国民健康局“全国绩优社区优良单位”表扬。
11月，获经济部技术处“经济部创新服务业界科专银发族 U-care 旗舰计划”补助，成立“嘉义银发优质生活服务中心”，提供嘉义地区银发族更健康、安全、舒适的生活品质。
12月，通过新制医院评鉴优等，区域教学医院乙类评鉴。
12月，购置64切电脑断层扫描仪（64切CT），造福云嘉南地区心血管疾病高危险群民众。
12月，本院长期投入海外医疗工作，以医疗援助海外偏远地区人民的需要，获卫生署颁发“推动国际合作有功奖”。
财团法人嘉义基督教医院-2007年 1月，皮肤科购置“飞梭雷射时光机”，提升医疗服务内容。
3月，中医部荣获卫生署评鉴，为云嘉地区唯一“优等”之医院。
3月，全院基层主管前往上海、苏州进行参访。
3月，荣获行政院劳委会“两性平权友善职场”认证。
4月，小儿科医师陈博宪荣获“中华民国第十七届医疗奉献奖”。
5月，推动社区健康照护─卫生署参访嘉基、老人日照中心常乐园。
5月，本院癌症防治中心于参加“96度癌症诊疗品质认证试评”，在参与试评的8家医院中，本院获肯定。
5月，本院心脏外科完成云嘉地区首例微创“胸部主动脉瘤支架血管置放手术”。
7月，乳房特别门诊成立，提供优质就医环境、照顾妇女隐私。
8月，再耕园蜻蛉玉工房荣获劳委会2007年多元就业开发方案，计划执行单位优等奖。
10月，本院为提升对创伤患者的医疗救护品质，成立创伤小组。
10月，成立“病安品管中心”配合病人安全委员会及医疗品质委员会，执行全院病人安全暨品质管相关计划、推动、执行、监测。
10月，与菲律宾黎刹医学中心(Rizal Medical Center)缔结姊妹医院，成为嘉基在菲律宾的第二家姊妹医。
10月，新港乡溪北老人日间照顾服务中心开幕。
10月，嘉基荣获南区健保局评比为医疗服务品质的优质医院，分别获得急诊照护、糖尿病照护、人膝关节置换手术整体照护满意度中的前三名。
11月，启用第二台新型直线加速器，再创癌症治疗新纪元。
11月，本院事业废弃物与资源减量回收再利用，荣获全国医疗组第一名。
11月，太保市仑顶老人日间照顾服务中心开幕揭牌，成为双福基金会于嘉义县正式成立的第九个老日间照顾中心。
12月，本院接受嘉义市政府委托经营之长青园综合服务中心开幕。
12月，本院荣获环保署颁发“第16届中华民国企业环境环保奖”。
12月，推动医院营造英语医疗作业环境计划─外籍人士访查活动，荣获台湾医务管理学会评为优等院。
