凝神入气穴是内丹术小周天的基础功法。宋人薛道光在《还丹复命篇》上说：“昔日遇师亲口诀，只要凝神入气穴。”可见凝神入气穴在周天功法中的重要性。凝是凝聚，神是心神即意念。什么叫凝神?张三丰《玄机直讲》上说：“凝神者，收己清之心，而入其内也。”陆西星《玄肤论》中说，“凝神之要，莫先于澄神；澄神之要，莫先于遣欲。”而“遣其欲而心自静，澄其心而神自清。” (《清静经》)所以凝神是指在排除杂念的澄神的基础上，练功的意念较为集中，人处在比较安静的状态。
《玄肤论》中又说：“所谓凝者，非决然不动之谓也，乃以神入于气穴之中，与之相守而不离也。”因此，凝神以精神安宁为基础，入气穴是它的必然趋势。所谓“气穴”，《玄肤论》中说：“夫气穴者，乃吾人胎元受气之初，所禀父母精气而成者，即吾人各具之太极也。其名不一， 曰气海， 日关元， 曰灵谷， 曰下田， 日天根， 曰命蒂， 曰归根窍复命关， 即一处也。”这许多名称，都是指的下丹田。凝神入气穴，就是练功的意念集中于下丹。