分享
 
 
 

gelred

王朝百科·作者佚名  2012-04-12
窄屏简体版  字體: |||超大  

简介GelRed 和GelGreen 是两种集高灵敏、低毒性和超稳定于一身的极佳的荧光核酸凝胶染色试剂。其水溶染色剂通过美国环保局安全认定,废弃物可直接倒入下水道,而不会造成任何环境污染。(下载美国Litron Laboratories, Inc. 完整安全检测报告)

目前大多数商业化的核酸染料(凝胶染色试剂)总是在安全性、稳定性和灵敏性等方面不完全令人满意。例如,虽然 EB (溴化乙啶)作为目前使用最广泛的核酸凝胶染色试剂,能够在多数应用中提供可以接受的灵敏度,但它是一种高诱变性的化学物质。而且EB染色后具有较高的背景荧光信号(如图1)图1

。 SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被厂家宣传为最灵敏的凝胶染色试剂。但 SYBR Green I 尤其是 SYBR Gold 在常用的微碱性电泳缓冲溶液或预制凝胶中会快速降解,稳定性差导致染色效果极不可靠。 SYBR safe 被认为是市场上较为安全的核酸染料 ,但它的染色效果还远不及 SYBR Green I 。

至于国内有公司宣称的新产品Goldview,我们不想多加评论。因为从极为相似的对比试验结果来看,该产品似乎就是AO(丫啶橙 ,一种剧毒产品,且荧光亮度不佳)。请看Goldview 与 AO 对比试验结果(其中Goldview是从国内某公司采购,AO则来自SIGMA,报告来自开放生物)

GelRed 和 GelGreen 无论用于预制凝胶染色还是凝胶电泳后染色,都表现出了极高的灵敏度。为配合 312 nm UV 凝胶成像系统而设计的 GelRed ,在使用了我们新开发的具有专利的试验步骤后(该试验步骤中使用稀释的 NaCl 溶液替代传统的 TBE 缓冲溶液),在凝胶电泳后染色中优于或者至少相当于 SYBR Gold 。但与 SYBR Gold 不同, GelRed 在预制凝胶中使用时仍然有极高的灵敏度,事实上GelRed 在检测低浓度、微量 DNA 方面比 EB 表现出更高的灵敏度,尤其对小分子量的 DNA 检测非常灵敏(图1)。 GelGreen 可以满足使用 488 nm 激光凝胶扫描仪或者可见光激发的 Dark Reader 的研究人员的使用要求。 GelGreen 无论是在预制凝胶还是凝胶电泳后染色中都与 SYBR Green I 灵敏度相当,但不存在后者的不稳定性问题。实际上, GelRed 和 GelGreen ,特别是 GelRed 非常稳定,可以长期在室温下保存。当这两种染料稀释在 TBE 或者类似的电泳缓冲溶液中时甚至可以使用微波炉加热,便于采用常规方法制备预制凝胶。含有染料的预制凝胶可以成批制备,长期保存。

同样重要的是, GelRed 和 GelGreen 相比 EB 或 SYBR Green I 提高了安全性。 独立的测试服务公司( Litron Laboratories, Inc. )进行的标准艾姆斯氏测试结果表明, 在 18.5 μ g /mL (该浓度远高于推荐用于电泳后染色的 约 4 μ g/mL 的 3X 染色液 )浓度下, GelGreen 没有诱变性,而 GelRed 也仅在 S9 代谢活化时有微弱的诱变性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化学结构使其难以穿透细胞膜进入细胞,正是这一特性降低了染料的细胞毒性。如图3。相反, SYBR Green I 广泛地用于活细胞线粒体和核 DNA 染色,这正是由于它能快速的被细胞吞入。由于已知 SYBR Green I 对紫外线导致的突变有强烈的增强作用( Ohta et al.Mutat. Res.492, 91(2001) ),因此它的高细胞膜透性使它在紫外环境观察时成为凝胶染色的主要有害物质。

特性:高灵敏度GelRed 和 GelGreen 是目前市场中最灵敏的凝胶核酸染料稳定性极好可以使用微波炉加热,可以在室温下保存更安全艾姆斯氏试验结果表明,该染料的诱变性远小于 溴化乙锭 ( EB )广泛的适应性适用于预制凝胶和凝胶电泳后染色染色过程简单与 EB 一样,在预制胶和电泳过程中不必担心染料降解;而电泳后染色过程也只需 30 分钟且无需脱色或冲洗对 DNA 和 RNA 的迁移影响极小对核酸迁移的影响小于 SYBR Green I完美兼容与标准凝胶成像系统以及可见光激发的凝胶观察装置完美兼容

使用 312nm 激发的 UV 凝胶成像系统时, GelRed 可以完美的替代 EB ;使用 254nm 激发的 UV 凝胶成像系统或可见光激发的凝胶观察装置时, GelGreen 足以替代任意一种 SYBR 染料(见图 4 中的光谱图)

安全性测试

SYBR Dyes

GelRed

GelGreen

A) 5 min. incubation

B) 30 min incubation

图 3. 在37°C下,分别使用1X SYBR Green I, SYBR Safe, GelRed and GelGreen 对HeLa 细胞进行孵化,并分别在5分钟(A)和30分钟(B)后观察。实验显示SYBR染料迅速进入细胞并将细胞内的核酸染成亮绿色(以上仅图示 SYBR Green 1),而 GelRed 和 GelGreen 则因为不能穿透细胞膜而完全没有进入细胞内, 足以证明GelRed和GelGreen是安全的。

要想让DNA染色剂安全,唯一的办法就是设法不让其穿透细胞膜进入活体细胞内,Gelred/Gelgreen 做到了!

图 4. GelGreen (绿色) GelRed (红色)在 PBS 缓冲溶液中结合 dsDNA 后的激发和发射光谱。

图 5. 室温下, GelRed ( 500 nm )和 SYBR Gold ( 488 nm )稀释在 1 × TBE 凝胶染色液中测得的吸光度随时间变化图。 GelRed 和 SYBR Gold 初始的吸光度值分别为 0.029 和 0.051 。

 
 
 
免责声明:本文为网络用户发布,其观点仅代表作者个人观点,与本站无关,本站仅提供信息存储服务。文中陈述内容未经本站证实,其真实性、完整性、及时性本站不作任何保证或承诺,请读者仅作参考,并请自行核实相关内容。
2023年上半年GDP全球前十五强
 百态   2023-10-24
美众议院议长启动对拜登的弹劾调查
 百态   2023-09-13
上海、济南、武汉等多地出现不明坠落物
 探索   2023-09-06
印度或要将国名改为“巴拉特”
 百态   2023-09-06
男子为女友送行,买票不登机被捕
 百态   2023-08-20
手机地震预警功能怎么开?
 干货   2023-08-06
女子4年卖2套房花700多万做美容:不但没变美脸,面部还出现变形
 百态   2023-08-04
住户一楼被水淹 还冲来8头猪
 百态   2023-07-31
女子体内爬出大量瓜子状活虫
 百态   2023-07-25
地球连续35年收到神秘规律性信号,网友:不要回答!
 探索   2023-07-21
全球镓价格本周大涨27%
 探索   2023-07-09
钱都流向了那些不缺钱的人,苦都留给了能吃苦的人
 探索   2023-07-02
倩女手游刀客魅者强控制(强混乱强眩晕强睡眠)和对应控制抗性的关系
 百态   2020-08-20
美国5月9日最新疫情:美国确诊人数突破131万
 百态   2020-05-09
荷兰政府宣布将集体辞职
 干货   2020-04-30
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案逍遥观:鹏程万里
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案神机营:射石饮羽
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案昆仑山:拔刀相助
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案天工阁:鬼斧神工
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案丝路古道:单枪匹马
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案镇郊荒野:与虎谋皮
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案镇郊荒野:李代桃僵
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案镇郊荒野:指鹿为马
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案金陵:小鸟依人
 干货   2019-11-12
倩女幽魂手游师徒任务情义春秋猜成语答案金陵:千金买邻
 干货   2019-11-12
 
推荐阅读
 
 
 
>>返回首頁<<
 
靜靜地坐在廢墟上,四周的荒凉一望無際,忽然覺得,淒涼也很美
© 2005- 王朝網路 版權所有