日本明治年代(1868-1912)前半期的棋杰。
生于伊予国大岛。其父为医生。幼有弈名，七岁时曾在今治城主御前对局。十三岁时已无敌与乡里。安政四年(1857)曾受本因坊秀策的指导，受四子二局，三子一局，压倒获胜(这三局棋在日本被认为是下手正确应对、击败上手的受子棋名局)。秀策与中川龟三郎(当时仍姓葛野)有意带其赴江户学弈。但其父认为下棋只是游戏而已，以体弱多病拒绝，未能成行。之后一直在家乡自学棋艺，达到三段棋力，并在当地小学当代课教师为生。
明治十二年(1879)四月方圆社成立后，社长村濑秀甫和副社长中川龟三郎多次致函缝治邀请加盟。明治十三年(1880)赴东京加入方圆社，定为四段。翌年升五段，明治十五年(1882)晋升六段。棋力为方圆社“四天王”(小林铁次郎、酒井安次郎、高桥杵三郎、水谷缝治)之首，是当时唯一能在受先相先条件下与秀甫抗衡的棋家。
明治十七年(1884)秀甫欲晋升缝治为七段，遭到高桥杵三郎的反对。于是由缝治授高桥先相先进行十番棋争棋，缝治六胜四负(前四局四连胜)，但未能将高桥降级，升段无望。时缝治所患肺结核已趋恶化，争棋最后一局结束仅十二天，于11月28日去世。年仅三十九岁。一年之后追赠为七段。
缝治棋风新颖机警，独具匠心。对局时有巧思妙着，有“鬼才”之称。