呼和浩特市卫生监督所是呼市卫生局依法行使卫生监督执法职能的执行机构，属副处级事业单位，经费实行财政全额拨款。人员编制120人，现有在岗人员119人，其中执法人员82人，高级职称16人，中级职称44人，初级职称45人。共设19个科室，行政科室6个，业务科室13个。具体承担《传染病防治法》、《食品卫生法》、《执业医师法》、《母婴保健法》、《献血法》、《职业病防治法》、《公共场所卫生管理条例》、《医疗机构管理条例》、《尘肺防治条例》、《放射性同位素与射线装置放射防护条例》、《化妆品卫生监督条例》、《学校卫生工作条例》等卫生法律、法规所规定的职能。
呼市卫生局卫生监督所的方针是：“内强素质、外塑形象、忠于职守、勇于创新、严格执法、廉洁奉公”，以新的姿态和作风服务于社会。