症状发病初期常见叶片先端变黄，6月间黄色部位逐渐变褐枯死，并由局部扩展到整个叶缘，呈褐色至红褐色的叶缘病斑。其后病斑逐渐向叶片基部蔓延，直至整个叶片变成褐色或灰褐色，枯焦脱落为止。7～8月病斑与健康组织的交界明显，病斑边缘呈波纹状，颜色较深，其外缘部分还可见较窄或较宽的鲜黄色线带。9月起，病斑明显增大，扩散边缘出现参差不齐的现象，病健组织的界限也渐不明显。此外9～10月份在苗木或大树基部萌条的叶片在不定部位上产生若干不规则的褪色斑点，中心褐色，这些斑点虽不明显扩大，但常与延伸的叶缘斑相连合。发病期，于病斑上可见多种黑色或灰绿色毛绒状，即黑色小点状的真菌子实体。
发生规律观察证明，大树较苗木抗病，雌株随结实量的增加发病率明显提高。另外根部积水造成根系腐烂或树势衰弱也能导致发病早而严重。一般说施基肥的较施追肥的感病轻；冬季施肥的较春季施肥的发病率低。银杏与大豆间作发病较轻，与松树间作发病严重，距水杉树近的发病严重，反之，则轻。其原因可能是此病病原菌与间作树种的病原菌相同有关(如水杉赤枯病)。在土层浅薄、下土板结、低尘易积水的地段上栽植；或在基肥不足、地下害虫为害猖獗的圃地上育苗；当起苗伤根、定植窝根等情况下，则叶枯病发生均较严重。据田问普遍调查，凡出现上述因素的地方，都可能导致银杏根系发育不良，生长受阻，甚至根腐。这类植株在春季展叶一个余月后，就会表现为早期黄化。不久，黄化株大多首先感病。
