地理位置甘肃祁连山国家级自然保护区地处青藏、蒙新、黄土三大高原交汇地带的祁连山北麓，地理位置在东经97º25′～103º46′，北纬36º43′～39º36′，属森林生态系统类型的自然保护区。保护区总面积为2 653 023hm²，其中核心区面积为802 261.6hm²，缓冲区面积为470 625.2hm²，实验区面积1 380 136.2hm²。1988年由国务院批准成立甘肃祁连山国家级自然保护区。
生态资源保护区生态地域复杂，植被类型多样，具有中纬度山地植被的特征。植物区系属青藏高原植物区，植物主要以阴生、湿生、寒生、寒旱生、中生、旱生植物为主。区内分布有国家级保护动物一级14种、国家二级39种。甘肃省保护动物6种；分布有国家二级保护植物4种。被列入《濒危野生动植物物种国际贸易公约》的兰科植物有12属16种；有国家一级保护昆虫2种、二级保护昆虫12种。共有野生动物28目63科286种，其中，鱼纲1目2科4种，爬行纲2目3科5种，两栖纲1目2科2种，鸟纲17目39科206种，哺乳纲7目17科69种。
旅游资源祁连山保护区旅游资源包括自然旅游资源和人文旅游资源2大类6个类型，景点遍布祁连山区。以生态旅游为主的森林公园有天祝三峡国家级森林公园、祁连冰沟河省级森林公园、山丹焉支山省级森林公园、肃南马蹄寺省级森林公园、民乐海潮坝省级森林公园，开发的旅游区香灵寺旅游区、昌岭山旅游区、大野口旅游区、丹霞地貌旅游区和大草原旅游区、 “七一”冰川旅游区等。
