机构设置公安部经济犯罪侦查局的主要职责是：
调查、汇集、研究、分析全国经济犯罪的情况、动向和规律；制定全国性经济犯罪的对策、方针、措施和规划；
依照国家有关法律，起草经济犯罪侦查的规章、条例、实施细则等，经过公安部领导审核发布实施；
掌握全国特大经济犯罪案件的侦破以及其它重大经济犯罪活动情况，检查、指导、督促侦查破案工作，必要时派人直接参与和指导某些特大经济犯罪案件的侦破工作；
组织跨省的重、特大经济犯罪案件的并案侦查和其它重大的经济犯罪侦查活动，发挥调度指挥功能，发布全国性的通缉通报，向基层提供信息技术支持和咨询服务；
直接承办党中央、国务院依法交办的经济犯罪案件。