中国医师协会培训部在中国医师协会领导下和中国医师协会医学教育工作委员会的指导下，根据卫生部医学教育的有关规定和要求，组织开展国内、国际间的医学教育活动和学术交流。负责完成卫生部授权的各项医学教育工作，制定实施符合国情的规范化培训计划，不断完善中国医师的各阶段医学教育。
培训部负责报送全国继续教育委员会认可项目，并将批准项目反馈各申请单位。
培训部负责审批存档全国继续医学教育委员会专项备案项目。
培训部统一管理协调中国医师协会各专业分会和业务部门举办的各种医学教育培训活动以及学分授予。未经正式报批和备案的培训项目，不得用中国医师协会的名誉授予医学教育学分。
毕业后医学教育在我国现阶段医学教育中尚不够规范。培训部着手策划、启动这项工作，并协助卫生部科教司完成毕业后医学教育的实施管理办法和方案，建立规范化的教育体系和制度。编写毕业后医学教育、医学远程教育等系列教材（试用），并力争将"继续医学教育"纳入工作规划，充实完善终身医学教育的内涵和体系。规范执业医师资格考试、考核，专科医师考核（试）和准入制度以及培训基地建设。
培训部执行全国继续医学教育委员颁发的《继续医学教育学分授予办法》授予学分，统一使用全国继续医学教育委员会监制、中国医师协会培训部盖章的学分证书。学分证书由专人负责管理，在不断总结经验的基础上，建立科学的学分管理和证书发放制度。
培训部应通过多渠道筹集经费开展各种医学教育活动，但不以赢利为目的，并以节约为原则合理使用经费。