东晋置东晋元帝初年（317年），以海虞县（今江苏常熟市）北境侨设南东海郡和郡治郯县，领郯县、朐县、利成等县。不久废。
南朝宋置宋永初二年(421）改侨东海郡为南东海郡,治侨置郯县（镇江市京口区），领郯县、、丹徒县、武进县、毗陵县、朐县、利城县等侨县。隶属南徐州。南齐因之。梁天监元年(公元502年),改南东海郡为南兰陵郡。南陈复为南东海郡。隋开皇九年（589）废入润州。