国家自然科学基金委员会管理学部是国家自然科学基金委员会的学术性管理机构，负责组织拟订管理科学领域的发展战略、优先资助领域和《项目指南》，负责受理、评审和管理各类管理科学基金项目，负责国际合作交流项目的组织与管理，负责专家评审系统的组织与建设，承担重要科学问题的咨询，承办自然科学基金委交办的其他事项。
管理科学是一门研究人类管理活动规律及其应用的综合性交叉科学。管理科学的三个基础是数学、经济学与行为科学。近年来，我国管理科学界在运用数学工具、结合经济学和行为科学等基础理论发展我国管理科学的理论方法、研究解决管理科学与管理实践中的问题等方面取得了一定的进展。
管理科学部为促进我国管理科学研究提高水平、走向世界，积极支持原创性强的项目申请，不断加大对创新项目的支持力度，鼓励跨学科的交叉研究。
管理科学部的管理体系由学术咨询系统和执行系统两部分组成。 学术咨询系统：即专家咨询委员会组成。
执行系统：按照"两级机构"的框架构成，
即科学部及下设的综合处、管理科学一处、