Y染色体亚伦（Y-chromosomal Aaron）是基因学理论上推测的摩西的哥哥，犹太教祭司家族亚伦后裔的Y染色体。根据摩西律法，亚伦的儿子们是犹太教的祭司一族。虽然西元1世纪罗马人毁灭了第二圣殿，祭司阶层的地位被剥夺。但直到今天，亚伦的后裔仍在犹太教内担任重要教职，被称为科恩家族（kohanim），冠以姓氏Cohen, Cohn, Kahn或者类似拼写。由于男性的Y染色体可以传给儿子，因此理论上，所有的亚伦后裔的Y染色体都应是属于同一单倍群。即使不同时代的基因突变会造成单倍型的微弱变化，但摩西和亚伦的Y染色体仍可以通过基因突变速率得到准确的基因型，即Y染色体亚伦。通过犹太祭司的姓氏和基因族谱学得出的染色体类型也被称为科恩模拟基因型（Cohen Modal Haplotype）。
摩西五书与基因测试《出埃及记》第29章1-9节“你使亚伦和他儿子成圣，给我供祭司的职分……把冠冕戴在他头上，将圣冠加在冠冕上，就把膏油倒在他头上膏他。……给亚伦和他儿子束上腰带，包上裹头巾，他们就凭永远的定例得了祭司的职任。又要将亚伦和他儿子分别为圣。”
根据摩西五书中对于亚伦祭司一族的描述，1997年，基因学家发现科恩家族的Y染色体分布与其他犹太人不同，而与同为科恩家族的欧洲犹太人相近。[1]1998年基因学家又发现利未家族不具备与历史猜测的Y染色体同一性，但科恩家族的染色体相近，共祖时代为3000年前。[2]
50%的犹太祭司家族科恩家族携带6种相同Y-STR基因标记，Y染色体类型为J1c3，可计算其始祖为106代以前，这个年代的计算结果与考古和旧约的记载大致符合，推出摩西所处的年代，3,190 ± 1,090 年前。
但除了犹太祭司家族以外，犹太人的Y染色体不类聚，这显然没有贯彻《民数记》第7章第3节的律法。这说明异族转信犹太教的情况相当普遍，特别是普通犹太人与周围中东居民，比如叙利亚人、阿拉伯人、黎巴嫩人的Y染色体分布相差无几，因此是这些中东民族的祖先是相通的。犹太人的母系基因比父系基因更具有多样性。这表明，皈依犹太教的女性要远远多于男性。科学家认为这并不奇怪，犹太人战败丧国，先后被巴比伦人、亚述人、希腊人、罗马人殖民，且因巴比伦之囚，广泛分布于西亚地区，与西亚各地居民融合在一起。西元1世纪，犹太人反抗罗马人的统治，战败，耶路撒冷犹太人大批死亡，第二圣殿被毁，祭祀阶层不复存在，拉比教派崛起，犹太会堂开始出现，犹太人只能在犹太教和犹太会堂里维系自己的宗教意识和民族身份。于是遗憾的是，到了18世纪，犹太人的基因和以前相比发生大幅度改变。[3]
犹太裔黑人的证实黑犹太民族的犹太血统也得到了确认。南部黑非洲有一群信仰犹太教的黑人，Lamba，他们的Y染色体，其中三分之一是明显的班图族黑人土著的，另外的三分之二大部份则是千真万确的犹太祭司基因－－Y染色体亚伦。当然这并不能证明黑犹太民族的原始，也可能是通商通婚产生的。而他们的母系则都是黑人土著。
撒玛利亚人的Y染色体亚伦撒玛利亚人是亚述攻陷的北国以色列的后裔。而犹太教是在南方的犹大王国中成熟的，犹太人从巴比伦回到故地后，与北方撒玛利亚人的风俗习惯信仰产生差异，就不愿意在合并了。由于罗马帝国对撒玛利亚人的打压，目前以色列只有640个撒玛利亚人。撒玛利亚人是遵循了《民数记》第7章第3节的律法近亲通婚，2000年来都不与异族通婚，至今仍在本族5代父系以内通婚。近亲通婚和与异族通婚导致的缺陷后代的比率其实相差不大，因为近亲通婚的妇女结婚更早，后代更多，次品率降低。19世纪的人口瓶颈也使得撒玛利亚人的缺陷基因被清除。斯坦福基因研究中心的研究表明83%的撒玛利亚人确实和犹太人有共同的父系祖先，即Y染色体亚伦。但撒玛利亚人的母系却与伊拉克犹太人和巴勒斯坦人接近，说明历史上的确发生过撒玛利亚祭司阶层未被流放到巴比伦，而与被亚述安置到以色列的其他征服地区殖民者通婚的现象。[4]
