1999年8月，中谷粮油集团公司为进一步加强中央储备粮的管理，正式组建了中谷中央储备粮管理有限公司，负责统一管理集团所属的中央储备粮和新建的中央直属储备粮库。
中谷中央储备粮管理有限公司的机构设置为：总经理一人、副总经理四人、下设办公室、人事部、财务部、仓储部、综合部、设施部。所管理的中谷集团所属国家粮食储备库共计27个，分布在全国17个省、自治区和直辖市。
中谷中央储备粮管理有限公司在中国储备粮管理总公司和中谷粮油集团公司领导下，对中谷集团所承储的中央储备粮油进行全面管理。长期以来严格执行国家有关政策、法规和中储粮总公司的各项管理规章制度，始终以管理为中心、以轮换为重点，做到了中央储备粮数量真实、品质良好、帐实相符、粮情稳定、存储安全，达到了“一符、三专、四落实”的要求。