日本海上保安厅(简称JCG)隶属于日本国土基础设施交通省。
日本海上保安厅的工作目标：维护海上治安，确保海上交通安全，遏制海难事故，防止海上灾害，防治海洋污染，使海洋环境更加安全。
日本海上保安厅于1948年5月1日成立，主要职能包括海上治安管理、海上交通安全管理、海难救助、海洋环境保护和海上防灾。具体职能如下：
* 海上治安管理
主要包括海上巡视、领海警备、海上治安管理、打击海上刑事犯罪、防止走私和偷渡、打击海盗、防止不明船只侵入、海上交通事故调查、取缔非法渔业作业、情报收集、海上重要设施和重要物资运送警备等工作，同时，与周边国家积极开展交流与合作，维护海上秩序。
* 海上交通安全管理
一是负责海上交通管理职能，以及日本501个港口内船舶航行和停泊的监管，港内工程和水上水下施工作业的管理，同时对捕捞活动进行监督。在东京湾等通航密集区建立了多个海上交通管理中心，提供交通信息，管制船舶航行，提高海域的营运效率，在通航密集的86个港口内，掌握着船舶进出港的情况，以确保船舶交通安全。
二是负责测绘、编辑海图，确保航行安全。开展海底地形、水深、潮汐、天体位置等海洋科学研究活动，监测海流和潮流，测绘、编辑、出版海图、电子导航海图、水路志(航海指南)、潮汐表、航海(天文)历等航海图书。该厅下属的日本海洋数据中心是日本唯一的海洋数据库，负责收集和管理由境内外海洋科学研究机构提供的各种海洋数据和信息。
三是负责助航设施管理。负责日本5600多座灯塔、灯浮标和无线电航标灯等助航设施的管理和日常保养巡检，同时，还在日本沿海设置了58处水文设备监测海区的风向、风速、波浪等气象和水文情况，并随时提供气象、海况信息。随着海港(海湾)和航道的发展以及船舶的高速化和专用化，船舶的航行方式也发生了显著变化，考虑到海域的自然条件及船舶通航情况等各种因素，该厅有计划地进行助航标志的不断发展和完善，确保在日本沿海航行的船舶交通安全。
四是负责安全通信信息管理。拥有完善的安全通信信息网络，负责遇险通信、进出港通信、检疫通信、发生自然灾害时的紧急通信等，同时发布航行警告、航行通告、特大型船舶航行通报和海洋气象预报。该厅目前正在对传统的遇险和安全通信信息体制加以大幅度的改进，大量引进自动化设备，已将GMDSS(全球海上遇险和安全系统)投入使用。
* 海难救助
负责日本沿海和海上搜救区域内发生的船舶火灾、颠覆、沉船等海难事故时人命救助和现场救助工作。建立有完善的海上应急体制和应急预案，拥有反应高效的专业海上救助队，实施二十四小时不间断的值班体制，由巡逻船艇和巡逻飞机实施巡航监视，以备海难事故的发生。一旦发生海难事故，立即派出巡逻船艇、巡逻飞机前往海难现场施救，并通过日本船位报告制度，要求过往船舶前去救助。
为迅速有效地进行海难救助，还建立了包括通信卫星、海岸电台、船舶和飞机电台一体的海上搜救信息预警机制。其下属的海岸电台用国际遇险频率进行二十四小时不间断的守听，以便收到遇险信息时立即采取相应的措施。同时，电台还使用短波通信及其他通信手段，与远距离海域内的船舶联络，及时收集正确的船位信息。
当远洋船舶上的船员受伤或患病，船东等人请求紧急医疗援助时，该厅也将派出配有医生、护士的巡逻船艇或巡逻飞机前往现场，进行迅速有效的医疗援助。
* 海洋环境的保护及海上防灾
负责对日本周围海域海洋污染行为进行监控和处理，保护海洋生态环境，在发生重大自然灾害时，派出巡逻船艇、巡逻飞机前往现场，展开应急行动，救助灾民或运输有关人员和救援物资。该厅对油污损害发率较高的海域进行重点监控，以防止海上船舶、陆上工厂或海岸工程等排放废油、含油污水等污染物，其下属机构都配备有污油回收装置等油污清除设备，随时待命，以备重大溢油事故的发生。
另外，日本海上保安厅还积极参加国际交流活动，在与周边国家的海上保安机构举办高层会议、实施联合搜救训练、加强国际交流和合作的同时，也积极参加ＩＭＯ(国际海事组织)、ＩＨＯ(国际航道测量组织)、ＩＡＬＡ(国际航标协会)和ＵＮＤＣＰ(联合国药品统制计划)等的国际海事活动，同时，还对日本周边国家的重大自然灾害实施国际人道援助和救助。
日本海上保安厅现有各类人员12255人，每年经费预算约1682亿日元。其总部设在东京，内设行政部、装备技术部、警备救助部、海洋测绘部、海上交通部等5个职能部门，在全国各地下设11个海上管区，以及海上保安大学和海上保安学校等培训部门。
行政部主要负责公共关系、国际交往、人事管理、预算财务等工作；装备技术部主要负责船艇建造和飞机采购等工作；警备救助部主要负责公共秩序的维护、油污染反应和搜救等工作；海洋测绘部主要负责海洋测绘、航道测量、海洋观测、提供海图出版物和确保航行安全所需的信息管理等工作；海上交通部主要负责航行安全措施的实施、航标的设立、维护和运作等工作。
日本海上保安厅11个海上管区共下辖海上保安部66个、海上警备救助部1个、海上保安署54个、航空基地14个、航标事务所39个。拥有各类巡视船艇50多种，共计700余艘，其中载直升机巡视船13艘，大型巡视船40艘，中型巡视船46艘，小型巡视船20艘，消防船5艘，其他巡视艇200余艘，另外还有测量船、设标船、航标维护船和教育实习船等。拥有各类型固定翼飞机29架，各类直升机46架。
日本海上保安厅非常重视队伍建设和职工教育工作，其下设海上保安大学和海上保安学校。海上保安大学负责培养海上保安厅的干部职员，学生在四年半的学习期间里接受高等教育和培训，包括一般教育科目和外语科目，还有法学、行政管理学、航海学、轮机工程学、通信工程学等专业科目以及训练科目，在学完了本科教育课程之后，转入专业教育课程，同时还必须参加环球远洋航海实习，学习与海上保安实际业务相关的科目。海上保安大学除本科和专业教育课程以外，还有特修教育课程，以培养海上保安厅的初级干部，从一般海上保安官之中选拔成绩优秀的进修生，进行教育训练，学习所需要的知识和技术。
