为落实安徽省委、省政府及安徽省教育厅有关建设合芜蚌自主创新综合配套改革试验区的文件精神，进一步挖掘和整合我校学术资源，切实提高服务地方经济的深度和广度，我校于2009年3月筹备成立合芜蚌自主创新与区域经济发展研究中心。中心的成立意在构建理论与实际相结合的研究合芜蚌试验区建设和发展问题的平台，为安徽经济社会发展提供决策咨询和理论支撑。目前中心挂靠在我校经济研究所内。
合芜蚌自主创新与区域经济发展研究中心是一个多学科、合作型的学术研究机构。“中心”现有兼职研究人员24人，其中，71%的研究人员具有高级职称，54%的研究人员具有博士学位。中心现设有产业发展研究方向、风险投资研究方向、创新型企业成长研究方向、创新绩效评价研究方向、配套改革政策研究方向。中心的主要职责是：
1.围绕合芜蚌自主创新综合配套改革试验区的建设，组织开展由政、学、研多方人士参加的学术研讨活动，为试验区的建设提供理论支持和走势分析。
2.承接试验区内各级政府及企业委托的横向课题，努力服务于安徽经济及社会发展的实践。
3.根据合芜蚌三城市自主创新需要，提供富有针对性的创新型人才定向培训服务。
4.精心设计专门网站，为政府部门、高校、研究机构和企业之间搭建交流的窗口。
5.编印“中心工作简报”、“成果要报”。及时向省创新办、合芜蚌三地市及相关部门传递国内外自主创新动态，分析国内其他区域经济发展模式及配套改革政策设计，介绍中心研究人员最新成果。
