安徽全椒中学的前身是明万历年间的“望阳书院”，清乾隆中期更名为“襄水书院”。1902年始创为现代意义的中学，是全省创办最早的中学之一。1958年定名为“安徽全椒中学”。1961年郭沫若为学校题写校名。1999年被批准为安徽省示范性普通高级中学。同年，全椒中学初中部剥离并且被并入全椒县第三中学。2009年，全椒中学留在原址的高中部（即被批准为安徽省示范高中的部分）正式划归全椒慈济第一高级中学（全椒县政府和台湾慈济基金会合作办学，学校实行董事会管理，13名董事，全椒县政府方面占6席）。全椒县第三中学迁入全椒中学旧址，成为只有初中部分的全椒中学。
全椒中学四周襄河环绕。校园内有《儒林外史》作者吴敬梓少年读书登临的明代建筑“奎光楼”(现更名为国光楼），学校仿古风格的大门楼、实验楼与之呼应，校门口就是河滨公园，风景清幽宜人；校园里花木扶疏，凉亭、假山、喷泉、雕塑错落有致，最适合读书修身。新时期以来学校进一步发展，现在已建有科教馆、实验室、多媒体教室、微机房、中央监控系统、体操房、生物标本室、音乐教室、校内无线电发射台等一系列现代化的教育、教学设施。新修建了天文台、网球场、游泳池、排球场。学校师资力量雄厚，现已形成一支以中高级教师为主体，多学科齐备，具备丰富的教书育人经验的教师队伍。
全椒中学桃李满天下，学子遍五洲。解放前就有一大批校友成为革命家、政治家、学者、教授；解放后培养出的人材更多；据不完全统计仅教授就有近百人。新时期以来出过高考男女状元，出过代表我国首次参加世界中学生物理奥赛获奖的选手，80年以来向各类高校输送合格新生5000多人。这些学生有的正负芨海外，有的已在各条战线上做出显著成绩。
全椒中学的校训是“崇德启智、求实创新”。办学模式是以升学为主，学校规范加特色，学生全面加特长。近年来会考合格率、高考本科率、升学率均在滁州市名列前茅；学科竞赛成绩显著，连年有学生参加国家集训队；是“全国体育卫生先进单位”，“省艺术教育先进单位”。今天，全椒中学正全面推行素质教育，以崭新的面貌迎接新世纪科技浪潮的到来。
全椒中学中学将于2009年搬迁，至一所更大的学校，是由台湾慈济慈善机构赞助
