北京大学体育教研部的历史可追溯到民国时期。1917年蔡元培先生主持校务后，大力倡导“思想自由，兼容包并”，在很多场合，蔡元培先生把体育排在“德育、智育、美育”的前面，提倡“完全人格”，在民族危难的时候把体育排在了第一位。1922年第一次直奉大战爆发后，经蔡元培先生倡导正式成立体育部。其后，体育部虽然随着国家的兴衰几经跌宕，但一直致力于北京大学各项体育教学与活动，并且不断发展壮大。解放后，体育部随着我国教育的发展也进入了一个新的历史时期，为新中国的体育事业做出了自己应有的贡献。
北京大学运动场馆总面积约12万平方米，包括：五四体育中心、第一体育馆、第二体育馆、理科楼地下厅，体育协会20余个，体育教师43人（国际裁判2人，国家级裁判6人），体育教辅人员9人。北京大学体育教研部下设教学教研室、代表队教研室、科研教研室、群体教研室、场馆中心、行政办公室等部门，承担全校公共体育教学、体育科研、校体育代表队的训练和群众体育工作。体育课实行特色教学、网上选课、网上成绩管理，教师实行挂牌教学，体育课实行“合格-不合格”考核办法、改五项达标为12分跑，这些革新举措使得北大体育人走在了体育教育改革的最前沿。目前体育教研申请的“北京大学体育课程改革与实践研究”获教育部“十五”规划课题立项；“北京大学体育课教程”获北京市精品教材立项。1995年以来，科研工作成效明显，体育教研部教师在国内核心刊物上共发表科研论文150余篇，发表学术专著30余部，承担国家教育部、国家体育总局等省部级科研项目10余项。
除承担学校正常的教学、代表队、科研、群体工作外，体育教研部的教师还承担挂靠在体育教研部下的协会、社团、研究机构的兼职服务。这些机构有中国大学生自行车协会，北京大学妇女体育研究中心，北京大学武术研究中心以及健康中心。
２００３年２月２７日，国家体育总局批准北京大学建立体育社会科学重点研究基地。该基地成为北京大学１２个人文社科国家重点研究基地之一，吴志攀副校长任基地主任。按照国家有关文件要求，北大体育教研部将进一步优化机制，改善科研条件，加强队伍建设和人才培养，尽快提高研究基地的整体水平，努力成为我国体育社会科学研究的重镇，为创建世界一流大学的总体目标、构建与之相适应的特色体育而努力奋斗。
