单纯蛋白酶是仅由氨基酸残基构成的酶。脲酶，一些消化蛋白酶，淀粉酶，酯酶，核糖核酸酶等都属此列。
生物化学（Biochemistry）某些酶，例如蛋白水解酶等，它们的组成为单一蛋白质，其本身的氨基酸残基即可以形成催化活性中心，并能有效地实施催化功能，这类酶称为单纯蛋白酶。