定义区域定位（regional assignment）指将某一基因定位于某一染色体后，利用染色体结构的改变（例如缺失、易位等）确定其在染色体上的具体位置。区域定位对于生产管理来说则是指对准备建厂或者准备建的销售点周边进行考察、定位，从而来确定生产点或销售点的建立可行性及生产、销售的目标客户，最终确定是否建点生产、销售。
实例：如人的某一蛋白质或酶在含有易位染色体的杂种细胞中表达，就可以将编码此蛋白质或酶的基因定位于染色体易位的区段。
操作方法：应用杂种细胞进行基因定位时，一般采用人的成纤维细胞或淋巴细胞来培育杂种细胞，因为在这两种细胞中有许多基因是不表达的。
应用问题另外，染色体定位和区域定位方法大都是依赖于检测细胞内的基因产物，但是许多基因，如调节基因、某些疾病基因等没有相应的基因产物。因此，多种基因定位方法的相互补充是必要的。
