棕色大熊猫是一种较为罕见的大熊猫变种个体。截止2009年，有科学记载以来世界上一共仅发现过五只棕色大熊猫[1]，发现地点均为大熊猫的重要栖息地之一秦岭南麓的汉中佛坪及其周边地区。
发现记录第一只（1985）
有科学记载以来世界上第一只棕色大熊猫，1985年发现于佛坪自然保护区大古坪村，当时它身患重病，经全力抢救，成活后寄养在当时的西安动物园，取名“丹丹”。“丹丹”在西安动物园共繁殖两胎第一胎产两仔，其中一只生下来就水肿死亡，另一只仅存活两天。1989年，“丹丹”又产下一只正常的黑白大熊猫，取名“秦秦”。“丹丹”于2000年被癌症夺去了生命，“秦秦”成了“丹丹”惟一可以延续的血脉。但不幸的是“秦秦”没有留下儿女，就于2006年11月23日暴病死亡。“丹丹”的标本现存于佛坪自然保护区。
第二只（1990）
第二只棕色大熊猫是1990年2月佛坪自然保护区的工作人员在该区三官庙地区考察时发现的，它是一只成年大熊猫，但当工作人员试图再靠近观察时，它迅速消失在茫茫的竹海之中，再未出现。
第三只（1991）
第三只棕色大熊猫是佛坪自然保护区工作人员梁启慧于1991年6月在佛坪自然保护区光头山考察时发现的。同时发现的还有1只黑白色的成年大熊猫。黑白色成年大熊猫约75公斤，棕色大熊猫约15公斤左右，它们一前一后在海拔2600多米的南坡松花竹林中活动，被判断是母子关系。
第四只（1992）
第四只棕色大熊猫是1992年在佛坪周边的长青保护区发现的。
第五只（2009）
第五只棕色大熊猫是2009年11月1日中午1时左右佛坪自然保护区的工作人员在佛坪自然保护区内大熊猫分布的核心地带三官庙地区被发现的，是一只棕色大熊猫
幼仔。当时，佛坪自然保护区工作人员梁启慧正跟另外4名工作人员例行巡山，当在竹丛中发现这只幼仔时，发现大熊猫身上通常生长黑色毛的部位，它却长着棕色的毛。在这只幼仔的周围，科技人员发现了一直在觅食和监护它的妈妈，大熊猫妈妈身上的毛却是黑白分明。“这是有科学记载以来所发现的第五只棕色大熊猫，也是佛坪自然保护区发现的第四只。”梁启慧说[1]。
原因分析目前，科学家对这种现象有下面几种推测：
第一种认为棕色大熊猫的出现可能是由于影响毛发色素合成的微量元素在秦岭地区的土壤、水源中含量异常，因而影响它的毛发中的黑色素的合成。但如果是这个原因，该地区所产的大熊猫种群中似乎应该有从黑色到棕色变化的各种毛色的中间类型，但迄今为止尚未发现这样的居间类型；
第二种认为棕色的体毛是由于基因突变所引起的，但在自然界由于基因突变而影响毛色的现象出现的概率很低；
第三种认为棕色毛色是一种原始的性状，即返祖说；
第四种认为这是一种隐性基因纯合的结果，假设体毛的颜色由一对基因来控制，则控制棕色体毛的基因为隐性。只有当亲本双方同时携带有这种基因的时候，它们的子一代才可能出现隐性基因纯合，从而生长出棕色的体毛。第四种解释虽然似乎比较圆满，但由于人们目前掌握的有关资料还很少，所以要揭开棕色大熊猫之谜还有待于进一步的研究。
首只棕色大熊猫的发现1985年3月26日汉中佛坪县岳坝乡大古坪村村民吕国友在悬马沟竹林深处发现一只棕白色相间的患病大熊猫，经抢救成功后很快恢复了健康，熊猫专家潘文石说，这只棕白色的雌性大熊猫是迄今为止所见到的世界上唯一一只棕色大熊猫，给它取名叫“丹丹”，它在世界动物史上竖起了棕色大熊猫的里程碑。
对于大熊猫来说，不仅现在人们在野外和在动物园中所见到的大熊猫为黑白相间的体色，在我国众多的古籍和医书中所描写大熊猫的颜色都是“黑白驳”，世界各国的自然历史博物馆所收藏的600－700个大熊猫标本，以及各种科学论文和其他文献上提到的大熊猫的毛色也都是黑白相间的。那么有没有其他颜色的大熊猫呢？1985年3月26日，在陕西秦岭的佛坪自然保护区内一个海拔大约为1200米的河谷中，发现了1只患有重病的大熊猫，身体极度衰弱，后来经过保护区的工作人员和各个方面的协力抢救，才转危为安，病愈以后寄养在西安动物园，取名“丹丹”，当时年龄为13岁，体重60多千克。与众不同的是，丹丹的毛色并非黑白相间，而是棕色和白色相间。
这是世界上科学界首次发现体毛为棕色的大熊猫，此后于1990年和1991年，在佛坪自然保护区内的竹林中又有2次分别观察到棕色大熊猫的1只成体和1只幼仔。据居住在秦岭的一位老猎人说，他曾经早在1954年就在野外见到过一只毛色与丹丹相同的大熊猫。此外，还有其他人也曾在野外见到过棕色大熊猫的1只成体和1只幼仔。所以，在秦岭很可能一直同时存在着具有两种不同毛色的大熊猫，但棕色大熊猫并不是一个独立的种群。棕色的体毛被科学家们认为是很多动物的一种原始性状的表现，那么在秦岭发现的体色为棕色与白色相间的大熊猫很可能是它的一种返祖现象。
1986年4月，大熊猫丹丹发情期间，分别通过利用冷冻精液进行人工授精和与饲养在佛坪自然保护区的雄兽“弯弯”交配的方法使之怀孕，并于当年9月13日产下2个幼仔，但都没有成活。1989年4月丹丹再次发情时，又与弯弯交配，受孕后于当年8月31日产下1个雌性幼仔，经过精心护理，幸运地存活下来，但生长发育比较迟缓，取名“秦秦”。不过，丹丹所生育的幼仔的毛色均为黑白相间，并没有任何棕色。
