琼山中学创办于一九一三年四月十五日。系由民国初年的琼山县县立第一高等小学发展而成。而后又合并琼山县县立师范学校。上述两之踪迹，则源于宋明年间的琼崖“雁峰书院”。 明代名臣丘浚和海瑞二公曾求于雁峰书院。雁峰原位于府城南门，原地称“琼庠”，对面有个三元峰，因常有雁群聚栖，当时在此读书的丘浚便作《雁聚琼庠记》。后人遂取名“雁峰书院”。清朝末年，由于时代思潮的冲击，科举制度被废除，各地书院相继改为学校，雁峰书院当时也改为雁峰两等小学（即高等和初等小学）。不久又改为高等小学，这就是琼山中学的前身。
一九一一年，雁峰高等小学在校长曾对颜先生的领导下发展迅速，规模不断扩大，学校声誉日高。一九一三年遂奉命改为琼山县县立第一高等小学，由当时的琼山县开明绅士张瑞銮任校长。张校长到任不久，就在第一高等小学的基础上着手创办琼山县县立中学（附设小学部）。张瑞銮升任中学校长。确定四月十五日为学校创办日。
中学创办初期，校舍紧缺，为解决这一困难，一九一四年经当时琼山县县长蒋宗堪裁决，将中学部和小学部分开，中学部暂代府城古楼附近的苏泉书院为校址。一九一七年，为适应全县小学迅速发展的需要，社会上热心教育的人士便将小学部改为县立师范学校，并将琼崖工业学堂洋楼拆掉，在清代中军游击府遗址新建校舍（该校现校址的东侧）。县立师范学校及附属不学但从雁峰书院迁入新址。一九二二年，琼山县立中学也因苏泉书院校址窄小，难展宏图，且系借用之地，非长久之计，后经 省府批准，将当时破烂不堪的琼州府
旧府署修缮一新，于当年十一月十一日兴校迁入新校址（现校址）。然而，由于与县师范只是一墙之隔，教学和生活安排都颇感不但，一九二六年二月，县教育会长李春荣便呈报省教育厅批准，将两校合并。一九三一年，师范班和小学班停止招生，琼山中学便成为单纯的普通中学。在师生员工的鼎力奋斗下，学校生机勃发，规模不断扩大，此段发展变迁延至一九三七年。
不幸的是，当时日敌侵华，国难当头，民族面临危亡，府城屡遭日几机轰炸骚扰，为师生安全计，学校迁至琼山县龙塘墟（现龙塘镇）。一九三九年海南沦陷，学校被迫停课。自雁峰书院以来
所积存的贵重书籍和资料，师生档案及教学设备等，在日寇的铁蹄下荡然无存，几经沧桑而发展起来的琼山中学，也跟灾难深重的祖国一道，惨遭浩劫。学校虽然提课，但琼中的学子们为了追求知识和真理，仍几个人、十几人乃至几十人自动聚在一起，分散在各地继续学习，其精神令人钦佩。
一九四五年抗战胜利，县长陈哲委任陈继福为校长，组织琼山中学在甲子墟复课。校址设在甲子墟的小学里，分散在各地的师生陆续返校。是年十一月，学校从甲子迁至海口市西门外竹林村的原日伪琼 崖女子一中校址。一九四六年上半年又从海口迁回府城原址，并多方发动社会力量集资，整修校舍。当
时的县商会和县公产整理委员会陆绣轩、王先生等都给予大力资助。至一九四九年，学校发展已具相当规模。初中已招76个班，高中部已招10个班。
一九五零年五月海南解放，琼山县人民政府派员接管琼山中学，在新校长未委派之前，由梁朝栋（冯白驹将军当年的老师）、曾祥鹏、吕承徽等五位老师组成校务委员会，负责学校行政事务。八月，海南文教处派王运应接任校长。
此后，在党和人民政府的重视下，县委书记兼县长王月波极为关心并大力支持琼山中学办学。学校诸多困难得到解决，师资队伍不断充实，校舍每学期都有所扩建，学校图书馆藏书下下子增至5000多册，各类教学仪器也有400多件，教学质量显著提高。一九五一年，海南文教处举办作文、歌咏、美术、演讲、壁报和足、排、篮球等比赛，我琼山中学学生均名列前茅。
一九五二年五月，琼山中学随琼山县人民政府一起迁往岭脚。但由于那里岭高地僻，交通不便，各方面条件都较差，一九五五年五月，一段稳定发展的时期，办学质量有明显提高。杨兹楠考上清华大学，吴坤定等一批学生分别考取北大、复旦等全国名牌大学生。
一九五八年十二月一日，琼山县同海口市实行市县合并，学校遂改名为海口市第三中学。一九五九年十月十八日，琼山复县，学校又复名为琼山中学。至此，琼山中学几经迁址和易名，应该是立稳脚跟等展宏图了。
然而，一九六六年下半年，全国发起“文化大革命”，学校发展又遭挫折。与全国各地一样，学校“停课闹革命”。一九六六年下半年学校又改名为“海南前哨中学”，一九六九年下半年才复名为琼山中学。时至一九七六年，学校正常的教学秩序才得到真正的恢复，学校开始迅速发展。一九七八年原教学大楼落定，各方面的办学条件得到很大的改善。一九七八年，学校被定为琼山县重点完全中学，师资力量得到调整和充实，学校的教学质量和办学成绩都显著提高，声誉日益提高，影响不断扩大。
中国共产党第十一届三中全会以后，特别是改革开放海南建省办大经济特区以来，琼山中学更是迅猛发展。学校的校容校貌建设和办学条件，从根本上得以改变。由琼山县政府拨款，一九八四年建成科学馆，一九八六年建成图书馆。一九八五年由著名校友杨兹楠捐赠人民币柒万元建成新校门，同时捐赠人民币伍万元设立“杨兹楠奖学金”。一九八八年由旅港乡
亲黄有雄先生捐资人民币捌万元建成“有雄楼”、由旅港乡亲、校友黄奕金先生出资人民币叁万元建成两个读书亭——“敬师亭”和“校友亭”；一九九二年由台胞吴乾华先生捐资港币肆拾万元建成乾华楼；一九九三年由琼山市洗笃信先生赞助人民币捌拾万元建成笃信艺术馆，符昌海先生和云龙镇政府分别捐赠人民币伍万元建成昌海廊和云龙廊；一九九四年由琼山县人民政府拨款三百万元改造大操场，建起宏伟壮观的司礼台和标准的三百米八道跑道，改造了全校的排水系统，彻底解决了大操场常年积水淤泥问题；一九九二年至一九九七年学校男女学生装宿舍楼、商品公寓楼、第4至第8栋教工宿舍楼相继落成；琼山市青年企业家郑先平先生向学校赞助人民币壹佰伍拾万元，用于改造校道，装备校文工团等。郑先平先生被琼山市人民政府聘为琼山中学名誉校长。由琼山市人民政府拨款捌佰万元，琼山市青年企业家许振发先生赞助壹佰伍拾万元，学校自筹壹佰伍拾元筹建，一九九九年九月二十九日剪彩落成全省一流的新教学楼；同年十二月，学校自筹壹佰贰拾万元改造学生食堂。从根本上改变了学生零散用餐的历史，为学生提供了卫生条件好的食堂，用餐舒适的餐厅。社会上关心教育的人士和广大校友都对琼山中学办学给予支持。自此，学校的办学硬件已具备相当规模，教育质量也一年比一年提高。
一九九二年升入各类大专院校的学生人数突破三百人大关，此后每年高考升学率一年比一年提高。很多品学兼优的学生考入清华大学、北京大学、中国人民大学、复旦大学、武汉大学、中山大学等全国名牌大学，二000年许敏考入北京大学，二000一年何贤超、陈定佳考入清华大学。中考成绩也一直居琼山市前茅；近10年间学生参加全国、全省学科竞赛有438人次获奖。学校男子排球89至91年连续三年获得全国中学生“振兴中华杯”排球赛第二名，在省内比赛也一直居于第二名的位置上；二00一年夺得海南省中学生排球锦标赛冠军，并受海南省教育厅委托，组队代表海南省中学生参加全国中学生第八届运动会，在排球预赛中以全胜的成绩夺得第一名，在决赛中夺得第三名。创造了海南省中学生参加全国中学生历届运动会的最好成绩。学校文艺队、歌咏队多次获得省比赛的好名次，在海府地区享有很好的声誉；教师的教学论文、公开课评优课调教也多篇多人多次获全国和省的奖励，显示了高水平的师资实力。学校一九九二年被国家教委收录入《中国名校》一书。学校自一九九三年来，多次被评为海南省文明单位，卫生工作先进单位，
勤工俭学先进单位，拥军优属模范单位，中学学德育工作先进集体，获海南省校容校貌建设评比一等奖，全国群众体育工作先进单位，全国学校卫生工作先进单位，全国先进少年军校，五.四红旗团委创建单位、全国精神文明先进单位等。由校团委学生会主办的校报《校园风》于1996年和1997年分别获全国优秀校园社报奖。二00一年五月，学校被海南省人民政府教育督导室（办学水平综合评估）评估为海南省一级完全中学；被教育部、全国妇联评为全国优秀（示范）家长学校。
二00二年，琼山中学高中部招生已至247个班，初中部招生已至364个班；九十年来，先后培养出高初中毕业生近四万人，校友遍布全国和世界各地；其中不少人已成为国内外知名的专家学者，有教授、工程师、企业家、外交家和各级党政的优秀工部等等。如被周恩来总理赞誉为海南人民的一面旗帜的冯白驹将军，海南大学第一任校长、著名生态学家林英教授，广东民族学院原院长蔡仲淑教授、华南师范大学副院长、物理学家王开发教授、获得第十一届亚运会第一枚金牌的著名举重女运动员刑芬等等，都曾是琼山中学的学生。
琼山中学地处人杰地灵的古城府城镇。府城（历史上的琼州府所在地）素来是琼山市乃至琼岛文人学士云集之地。琼山中学创办于1913年4月15日，系由当时琼山县立高等小学发展而成，而县立高小的前身则是宋明年间的琼崖雁峰书院。明代名臣丘浚和海瑞曾就读于雁峰书院。学校迄今已有91年历史，现在是琼山市重点完全中学，其办学成绩被载入国家教委编写的《中国名校》一书。
琼山中学占地面积80亩，校舍建筑面积5万多平方米，现有56个教学班，初、高中学生3647人，教职工268人，其中省优专家2人，特级教师2人，具有中高级职称的教师占教师总数70％，师资力量雄厚。
琼山中学是海南省一所办学历史悠久、知名度较高的市（县）重点中学。多年来，学校本着正确的办学思想，先后培育出初、高中毕业生4万多人。他们中，有的已成为政绩卓著的党政领导；有的已成为科技领域的学者专家；有的在商界叱咤风云；有的在平凡的岗位上做出不平凡的贡献。琼山中学的广大校友，遍布在祖国和世界各地，他们运用在母校学到的知识和本领，在各个领域展示着各自的才华。
改革开放以来，琼山中学在上级政府的关怀和支持下，认真贯彻落实党的教育方针，坚持正确的办学指导思想，加强教育教学管理，积极开展勤工俭学活动，努力改善办学条件，大大提高了教育教学质量。
进入九十年代，学校以培养跨世界人才为己任，坚持“三个面向”，从严治校，科学管理，重视德育工作，创办少年军校，丰富校园文化生活，注重素质教育，培养德、智、体全面发展的人才。学校不断深化教学改革，全面提高教育教学质量，升学率逐年提高。近几年来，学校有一批批品学兼优的学生考入清华大学、北京大学、中国人民大学、复旦大学、中山大学等名牌大学。在参加全国、省级以上各学科学艺竞赛中，琼山中学也取得了优异的成绩。历年学校参加全国、省、市文体比赛都获得较好的名次，特别是男子排球队多次获得海南省中学生排球赛冠、亚军和全国中学生排球赛前三名。2001—2003年，该校男子排球队连续三年荣获省中学生排球赛冠军，该校男排代表海南省中学生参加第八届全国中学生运动会男子排球赛荣获预赛第一名、决赛第三名，以该校男排为基本班底组队代表中国中学生参加在香港举行的亚洲中学生男子排球锦标赛荣获冠军。该校文艺队多次参加省、市文艺汇演荣获一等奖，该校不少学生参加全国、省级书法美术比赛都获得好名次。近5年来，学校教师的教学论文共有106篇发表在省级以上报刊杂志上，其中69篇获省级以上奖励。在省市教师调教中，该校教师也频频得奖，显示出了较高的师资水平和实力。
近十年来，琼山中学坚持“人民教育人民办，办好教育为人民”的宗旨，依靠人民群众的力量，加快学校基础设施建设和危房改造工作。学校采取国家拨一点，社会捐一点，学校自筹一点的方法，将过去所有砖瓦结构的教室、宿舍改建为明亮的钢筋水泥教学大楼和宿舍楼，并建起了现代化的科学馆、图书馆、艺术馆。学校教学条件大大改善，教学设施齐全，设备先进，教学手段逐步现代化。特别是近几年来，在全国实施素质教育中，学校电脑室、多媒体教室、语音室、电化教室和音体美等教学设备的相继投入使用，极大地促进了教育教学质量的提高。
近年来，琼山中学校容校貌建设取得了喜人的变化。琼山中学按照名校的标准不断优化教育教学条件，自力更生，争取社会各界的支持，加大资金的投入，搞好校容校貌建设。现在，校园基本上实现了绿化、美化、香化、净化、园林化。校园中，楼房林立，绿树成荫，花草繁茂，四季如春；学校的教学区、运动区、生活区布局合理，亭台楼榭错落有致，水泥校道纵横交错；园、林、路、花、草巧妙布局，互相点缀，整个校园呈现一派生机勃勃的景象，为师生创造了一个良好的学习和生活环境，是理想的育人胜地。
琼山中学全面贯彻党的教育方针，狠抓校纪校风，建设文明学校，办学成绩显著，多次受到国家、省和市有关部门表彰。近十多年来，学校先后被评为琼山教学教研先进单位、琼山精神文明建设先进单位、海口市法制教育先进单位、海南省勤工俭学先进单位、海南省文明单位、海南省“双拥”工作模范单位、海南省学校体育工作先进单位、海南省文明单位标兵、海南省中小学德育先进集体、海南省一级完全中学、海南省文艺工作先进单位、全国群众体育工作先进单位、全国卫生工作先进单位、全国先进少年军校、全国优秀（示范）家长学校、全国精神文明建设先进单位。现在，琼山中学正朝着建成“全国知名、全省示范”学校的办学目标，脚踏实地向前迈进。
现在琼山中学正面向21世纪，以创新教育为目标，全面加强学校建设和管理，为创办全国一流中学而奋斗。
