2004年5月18日，上海泛亚航运有限公司庆典在上海远洋宾馆举行。交通部水运司副司长张国发，中远集团党组书记张富生、副总裁王富田、陈洪生，上海市、全国各港航口岸单位领导，泛亚公司重要客户代表以及中远集运公司领导许立荣、吴树雄、刘昌龙、陆富根、周琥、韩成敏、蔡张德、徐政军、邓黄君等出席成立庆典，洪浩、张富生为新公司成立揭牌。
上海泛亚航运有限公司是中远集运运输有限公司的全资公司，注册资本6.688亿元人民币，组合了中远集运中日贸易区和沿海贸易区经营管理职能，主要专业化经营包括中日航线内贸航线及公共支线在内的中国近洋集装箱运输业务，目前拥有船舶24艘，租用船舶9艘,总运力为30,400TEU。新公司的成立，将有利于细分市场，依托体制创新，为目标客户提供更为个性化产品。有利于资源有效配置，建立良性发展机制，实现精细化经营。有利于加快对市场的快速反应，提高服务水，适应市场，创造市场。
同年12月份，为加快完善中远集运中国国内支线网络步伐，做强做大支线运输业务，长江流域内支线经营主体也转移至泛亚公司，以提升核心竞争力。按职能划分为：中日经营部、沿海经营部、支线经营部、经营保障部、财金管理部和行政管理部。