丙酮酸氧化脱羧生成乙酰辅酶A，乙酰辅酶A在三羧酸循环（TCA）彻底进行氧化生成CO2+H2O和ATP
是有氧呼吸的第二三阶段
第二阶段：丙酮酸氧化脱羧
丙酮酸+NAD++HS-CoA→乙酰CoA+NADH+H++CO2
丙酮酸脱氢酶复合体：丙酮酸脱氢酶（E1）：TPP
转乙酰化酶（E2）：硫辛酸、CoA 二氢硫辛酰胺脱氢酶（E3）：FAD、NAD+
1．丙酮酸在丙酮酸脱氢酶（E1）脱羧形成羟乙基-TPP，产生CO2
2．由转乙酰化酶（E2）催化使羟乙基被氧化成乙酰基，同时转移给硫辛酰胺，再转移给辅酶A生成乙酰CoA后，离开酶复合体，并使硫辛酰胺还原成二氢硫辛酰胺。
3．在二氢硫辛酰胺脱氢酶（E3）催化下，使还原的二氢硫辛酰胺脱氢重新生成硫辛酰胺，以进行下一轮反应。同时将氢传递给FAD，生成FADH2，再将2H转移给NAD+，形成NADH+H+。
在整个反应过程中，中间产物并不离开酶复合体，这就使得上述各步反应得以迅速完成。
第三阶段：三羧酸循环（tricarboxylic acid cycle）
1．三羧酸循环的反应过程：
⑴柠檬酸的形成：乙酰CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸。
⑵异柠檬酸的形成：柠檬酸与异柠檬酸的异构化可逆互变反应由顺乌头酸酶催化。
⑶第一次氧化脱羧：异柠檬酸在异柠檬酸脱氢酶作用下氧化脱羧转变为α-酮戊二酸，脱下的氢由NAD+接受，生成NADH+H+。
⑷第二次氧化脱羧：α-酮戊二酸经α-酮戊二酸脱氢酶复合体作用氧化脱羧生成琥珀酰CoA，其组成和催化反应与前述的丙酮酸脱氢酶复合体类似。
⑸底物水平磷酸化反应：琥珀酰CoA的高能硫酯键水解时，可与GDP的磷酸化偶联生成高能磷酸键，由琥珀酰CoA合成酶催化。
⑹琥珀酸脱氢生成延胡索酸：反应由琥珀酸脱氢酶催化，辅酶为FAD。
⑺延胡索酸加水生成苹果酸:延胡索酸酶催化此可逆反应。
⑻苹果酸脱氢生成草酰乙酸：由苹果酸脱氢酶催化，脱下的氢由NAD+接受。
三羧酸循环的生物学意义
1．是机体将糖或其它物质氧化而获得能量的最有效方式。每分子葡萄糖经有氧氧化生成H2O和CO2时，可净生成32（30）分子ATP。
2．是糖、脂和蛋白质三大类物质代谢与转化的枢纽。是生物大分子分解与合成的两用途径。
