国际热带木材组织是国际热带木材协定的实施与管理机构。总部设在日本神户。其职能包括：提供有利于成员国和国际社会有关热带木材的经济信息，提供市场情报以确保热带木材市场更高的透明度；同国际非热带木材商品组织保持紧密联系；进行贸易和环境方面的政策研究，如研究热带木材贸易与可持续发展的联系以及木材制品的认证；在由联合国可持续发展委员会建立的政府间森林小组内有关贸易与环境问题上起领导作用。国际木材组织的理事会和常设委员会活动的基本任务是制定有关森林的重建和管理，森林工业的经济信息和市场情报的项目，并加以实施；为热带木材方面的研究与开发项目取得财政支持；进行可持续发展研究，为此，设立“巴厘伙伴基金”。