培元中学创办于1904年,办学初期，曾得到中国革命先行者孙中山先生的关怀，1920年1月，孙中山先生带头向培元中学捐款，并亲题“协兴教育”于捐册扉页；1920年11月5日，亲笔题写“共进大同”赠勉培元中学。1980年5月，国家名誉主席宋庆龄又亲笔题写“为国树人”赠勉培元中学。两位伟人的题词是培元中学的殊荣，也是长期以来对培元中学师生的鼓舞和鞭策。
培元中学创办以来，培养出无数人才，遍及全国及世界许多国家和港、澳、台地区，培元中学有许多毕业生成为著名的专家、学者、实业家和社会活动家。如：原中国科学院高能物理研究所所长张文裕院士，原燕京大学教授谢毓铭，原复旦大学校长谢希德，复旦大学首席教授苏东水，同济大学教授黄烈德，原中国音协主席李焕之，原厦门大学校长林祖庚，原福州大学、集美大学校长黄金陵，原吉林大学教授蔡镏生院士，原东南大学校长陈笃信，台湾中央研究院院士李亦园，中国国防科技大学副校长陈火旺院士，香港著名实业家、社会活动家黄保欣、吕振万、庄瑞杰、骆志鸿，泰国侨领李引桐，印尼侨领李尚大，菲律宾侨领王金炳等，他们都为国家的建设和教育事业作了很大贡献。
改革开放以后，学校积极开创侨资办学新局面。1979年3月，经政府批准，复称“培元中学”。1980年2月，成立校董事会，推举庄明理为董事长，张文裕、张楚琨、蔡镏生、王庆元、高明轩为副董事长。1983年7月，培元中学被确定为福建省首批办好的重点侨校之一。海外校友恢复了与母校的联系，并以极大的热情支持母校的复兴工作，为母校兴建校舍，添置教学设备，设立奖学、奖教金，学校呈现一派欣欣向荣的景象。
1994年7月，国务院副总理李岚清亲笔为培元中学90大庆题写贺词：“为振兴中华培养优秀人才作出更大的贡献。” 1994年10月，培元中学第二届董事会成立，推举黄保欣为名誉董事长，吕振万为董事长。
1996年，培元中学被确认为福建省一级达标中学，进一步激发了全校师生和广大海内外校友的办学热情，海外校友继续捐资办学，为学校兴建校舍，捐赠教学设备，设立奖教奖学基金，学校全体师生再接再厉，不懈努力，加大教改教研力度，推进素质教育的全面开展，巩固了一级达标的成果，并将学校的教育教学水平提高到一个新的台阶。
2002年6月，培元中学第三届董事会成立，推举黄保欣、吕振万为永远名誉董事长，李引桐、梁灵光、庄瑞杰为名誉董事长，骆志鸿为董事长。
学校于1996年被确认为福建省普通中学一级达标学校。1996年以来，该校进一步加强两个文明建设，实施高中课程改革，深化教学领域改革，全面推进素质教育，取得较大的成效:
（一）学校两个文明建设更上新台阶
1997年，该校被评为福建省“军民共建先进集体”， 1999年，被评为福建省军民共建“三挂钩”先进集体，2000年，被评为“福建省军民共建精神文明先进单位”，2001年被评为泉州市绿色学校，1991-2002年，连续5届（第4届-第8届）被评为福建省文明单位、文明学校，培元校友素有“爱校如家”的优良传统，1996年，学校通过一级达标，增强了广大校友办好培元中学的信心，他们对母校的事业倍加关注，为了促使母校早日腾飞，他们以更大的热情，支持母校的建设。
2002年6月，培元中学第三届董事会成立，推举黄保欣、吕振万为永远名誉董事长，李引桐、梁灵光、庄瑞杰为名誉董事长，骆志鸿为董事长。新一届董事会以更大的热情支持母校的新世纪发展。校友对母校的捐资从不间断。近两年落成的有吕振万综合楼、保欣广场、梓辉运动场等，2002年，在海外校友的支持下，学校征用了原泉州第五塑料厂厂房，扩大校园面积10亩，目前，学校在建项目有骆忠信教学楼、东方楼等。
（二）实施高中课程改革
2000年，省教育厅召开“研究性学习”研讨会，该校立即规划、拟定实施方案并在该年入学的高一年段开展这项活动。首先成立课题中心组，筹划该年段研究性学习活动计划，先后召开年段会、班会、讲解研究性学习的意义，提高教师学生参加这一教科研活动的自觉性。在班主任、科任教师的指导下，成立六十几个小课题组。学生们走进实验室、电脑室、图书馆，进行科学实验，查询有关资料，走出校门，走向城市的大街小巷、工厂、商店开展社会调查，访问技术人员、学者、社会贤达。研究性学习培养了团结协作的团队精神，开拓学生视野，增长人文科学、自然科学知识。当年被确定为“泉州市十项重点科研课题”。2001年5、6月，市教科研究进行中期检查，肯定该校研究性学习开展得有声有色。2001年9月，我们又在高一年段开展这一活动，我们调整活动方案，把研究性学习、选修课、活动课结合起来，把研究性学习规范化，并将学生优秀论文汇编。该校“研究性学习”获得泉州市优秀科研成果奖。2002年该校申请国家级“网络环境下的研究性学习”课题，这一课题科研一年后，初见成效，已准备中期检查。同时该校庄勇老师作为Intel未来教育主讲教师和其他教师一起承担市直学校Intel未来教育培训工作。为该校开展网络环境下的研究性学习创造了更好的条件。
该校除按《课程计划》的规定开设学科型的选修课外，开设的校本选修课继续坚持拓展型课程以“丰富知识，开拓视野，培养兴趣，主动发展”为重点，致力于“实践操作，探索方法，培养能力，发展特长”。全校每学年能开设五十多门选修课程供高中学生选择。选修课有教师，有教案，有考核，教学内容符合要求。该校把拓展型选修课分为理科科系，人文科系，学习策略，技术技能，体育艺术五个系列。既有长期课程，也有学期课程和微型课程；既有综合，也有专题；既有选修班，也有兴趣小组。力求类型多种，组织多样，内容丰富，特别注意体现学校办学特色及涵盖心理教育、健康教育、人口教育，地方、历史、地域、资源、新科技知识及环保教育。选修课由学生自主选择，教师因势指导，学校统一安排，力求满足各类学生发展个性，培养特长的需要。
（三）积极开展教改教研活动，深化教学领域改革
学校注重培养教研教改方面的创新意识，积极参与和开展教育科研活动。英语科及数学科率先试行“张思中教学法”与“自学—指导法”，以此带动全校的学科教学改革，这两个教改项目实行多年，已在全校推广，成果显著。该校曾经两次与省外语学会、市中学外语教学研究会合作举办张思中外语教学法培训会，推广张法教改试验经验，由该校教师作主题发言，开设观摩课，受到与会教师好评。该校《大面积提高中学外语教学质量实验研究》课题受到国家教委表彰，陈毓鹏老师荣获全国教育科研研究贡献一等奖，英语教师谢欣欣、许丽娜、赵竑受到教育部科教所表彰，评为“全国教育科研优秀教师”。
目前学校参与的国家及省级科研课题有：“中学阶段学好一门外语”、“网络环境下的研究性学习”、“高中生的心理健康教育”。
学校在教学手段上推陈出新，大力推行现代教育技术。学校特别重视对青年教师培养指导，有培养指导的计划措施，从97年起开展两年一届评选学校“十佳青年教师”活动，有力促进了青年教师素质的全面提高和健康成长。
该校拥有一支老中青结构合理的教师队伍。校长黄锦衣任泉州市物理教学研究会理事长，副校长潘龙溪任省物理教学研究会理事，陈毓鹏被评为特级教师，近二、三年来又涌现一批教学新秀，继2000年李宁老师获福建省思想政治课一等奖后，郑竹瑜老师又获省思想政治优质课比赛一等奖第一名，2003年10月代表福建省参加全国决赛，信息技术课教师王全井有关计算机论文获福建省一等奖、全国三等奖。王仁杰、黄开连在全国中学英语教师技能大赛获福建省赛区三等奖。目前该校有五位教师正在攻读硕士研究生学位。
（四）全面推进素质教育
该校始终坚持社会主义办学方向，全面贯彻党的教育方针，坚定地把培养能适应21世纪挑战的“四有”人才作为学校的办学目标，面向全体学生，积极实施素质教育，提高学生的全面素质。学校充分发挥该校师资力量强、教学设备设施完善，海外校友众多和侨资办学的优势，按照邓小平“教育要面向现代化、面向世界、面向未来”的“三个面向”精神，深化教学改革，提高课堂效益，充分发挥课堂教学在素质教育中的主渠道作用，坚持教学为中心，以学生为主体，以教师为主导，深化教学改革，实施素质教育。
学校按要求加强劳动技术教育和社会实践活动，在各年段开设有手工制作、园艺、英文打字、木工、电工初步、电子制作、机械制图、计算机等劳技课程。开设艺术欣赏课，培养学生艺术鉴赏能力。开展美术、书法、摄影、集邮展览，开展歌咏比赛、文艺演出、演讲比赛。组织花棚文学社、大同史学社、培元艺术团等各种学社活动。通过各类选修课、课外兴趣小组和各种活动的开展，对学生进行美育教育，发展学生的个性、特长。
同时，充分利用学校电脑设备，举办因特网夏令营，学校的电脑室向学生开放，几年来该校学生参加全省中学生信息技术统一考试均取得优异成绩。如99年优秀率为81%；2000年优秀率为66%；2001年会考优秀率为81%；2002年会考优秀率超过国家级示范性高中要求30%。学生参加各种省市竞赛共10人次获得好名次。
通过信息技术课的开设及多次举办电脑培训，大部分学生都能熟练掌握应用信息技术进行自主学习和探究学习，并将因特网应用在研究性学习中，能充分利用因特网丰富的资源优势扩大知识面，并通过对信息的搜索、整理过程中提高解决问题与互相协作的能力。
学校从素质教育的高度出发，一贯重视音乐和美术的教育和教学工作，把艺术教育纳入学校工作日程的安排，由校领导、政教处、团委会、美音教研组、年段长班主任通力协作，计划艺术教育教学及活动的安排，对艺术教育有专项拨款，用于扩建乐器、器材，更新、增设资料、服装道具等，学校艺术活动开展得有声有色。根据省教委颁发的课程计划，开足开好初中音乐、美术课、高中艺术欣赏及第二课堂的研究性学习。一年一度的班班有歌声“红五月”歌咏比赛，每学年开展的科技文化节活动，有科技活动、趣味体育项目比赛、美术作品比赛、主持人大赛、初中各班艺术节目比赛、高中的课本剧、英语小话剧比赛以及大型艺术节联欢晚会等；还选拔优秀节目到军民共建单位市武警支队、解放军180医院慰问演出；举办美术、书画展览；组织学生参加市教委举办的音乐美术书法竞赛，均获得优秀成绩；组织高中毕业生报考高等艺术院校，每年都有学生被录取。通过各种活动不断提高学生的审美能力、艺术鉴赏能力和艺术表现能力。
学校高度重视学生心理健康工作，该校成立心理咨询中心以来，不断进行心理健康教育的制度建设，已初步形成了硬件、软件一体化的心理健康教育网络系统，是国家、省、市三级心理健康实验基地。
