芜申运河是一条老运河，芜申运河从安徽省芜湖出发，经当涂、宣城至江苏的高淳、溧阳、宜兴，然后入太湖，穿太湖经太浦口在吴江市进入上海，全长271公里。该运河因历史原因未整治开发，航道等级低，水位变化大，航道深浅不一，且碍航桥梁多，大多为6至7级和等外航道标准，只能通行60吨级至100吨级船舶甚至更小的船舶。因此，长期以来，芜申运河一直未得到充分利用。近年来，随着苏南经济的快速发展和上海浦东的开发、开放，航行在苏南运河的船舶越来越多，航道通而不畅的矛盾日渐突出。为从根本上缓解苏南运河的航行压力，有关专家建议，对现有的芜申运河按三级航道标准进行整治，可起到缓解苏南运河航行压力的效果，同时也减轻了长江的航运压力。芜申运河改造完成后，可通航1000吨级驳船，不仅减轻苏南运河航运压力，航程也比从长江上通行缩短了170公里。预计4年完成。
从芜湖经南京至上海的长江水道走向是一条弧线，而芜申运河几乎是一条直线。据统计，目前南京籍船舶经长江至无锡、上海等地的千吨级以下船舶每年超过2万艘次，载货量达500多万吨，这些船舶改由芜申运河航行，每年仅节省油费产生的经济效益就达上亿元。芜申运河纵贯皖、苏、沪，穿越长三角，历史上就是长江入沪的重要通道。芜申线航道整治项目，是规划中的长三角地区“两纵六横”高等级航道网中的重要“一横”，也是我省“两纵四横”主骨架航道中的关键“一横”，对于改善长三角水运交通条件、完善区域综合交通体系、充分发挥水路运输优势、促进沿线经济社会发展等，具有重大而深远的意义。芜申线江苏段航道里程约254.7公里，分为高溧段（高淳至溧阳段）、溧宜段（溧阳至宜兴段）和太湖湖区段三部分，按三级航道标准建设，设计最大船舶通航能力为1000吨级。
2006年08月 安徽水运“一号工程”之称的芜(芜湖)申(上海)运河(安徽段)航道整治工程可行性研究报告已完成，勘察设计正式进行国内公开招标
2006年1月20日， 芜申运河宜兴绕城段航道整治工程顺利通过交工验收
总投资21.8亿元的芜申运河南京段航道2009年9月27日上午在南京高淳开工建设
