经济系自1980年创建以来，先后开设应用统计、工业会计、邮电会计、会计学、工业企业管理、税务管理、金融、财务管理等十多个专业，2004年调整后的合肥学院经济系设有五个专业：经济学（本科）专业、国际经济与贸易（本科）专业、金融学（本科）专业和房地产经营与估价（专科）专业、税务（专科）专业。目前，经济系有经济学、国际经济与贸易、金融学和房地产四个教研室和一个房地产研究所，专职教师30余人，其中，教授及副教授8人，留学回国人员2人，40岁以下教师具有硕士学位占总数的90%以上，具有中高级职称教师占总数的90%以上，专职教师均通过国内培训或出国进修。系资料室藏书近万册，订阅专业报刊杂志100多种。
经济系贯彻学院“地方性、应用型、国际化”的办学定位，致力于培养既具有扎实的经济学理论功底，又具有较强的实际操作能力和应用能力的、适应现代化经济管理需要的复合型、创新型、应用性专门人才，努力服务地方经济建设。通过四年的基础理论课和专业课的学习与训练，使学生能具备扎实的经济学理论基础，能熟练掌握并运用现代经济分析方法去分析解决实际经济问题；使学生具备深厚的专业素养以及对本专业学科前沿和技能的洞察力，具备进一步深入研究的能力；使学生在基础课和专业课之外广泛涉猎其他领域的知识，不断提升专业素质并拓展综合能力。
为培养学生的应用能力，结合学院的办学定位，借鉴德国应用科技大学教育模式，经济系已经进行学制改革，变“四学年八学期制”为“四学年九学期制”，在前四学期公共基础课和专业基础课修完后，总共15周的第五学期用于认知实习，第六、七、八学期再返校修专业课，第九学期为毕业实习和毕业论文学期。 经济系努力进行教育改革的同时，不断扩大对外交流与合作，先后派遣多名教师和学生赴德国、韩国进修，截止目前已有近百名学生赴德、韩等两国学习。
经济系现有学生1100多名，21个班级，学生来自全国16个省市、自治区。在当今信息化的社会环境中，我们的目标是培养适应社会需要的创新人才，努力塑造学生健全的人格和健康的心态。强调人文精神和综合素质的培养，无论是入学时的专业教育，学生读书科研活动，还是对学生行为的认知教育，以及应用型课程的教改实践，目的就在于给学生创造一个能全面发展、充分完善自我的良好环境。经过四年大学生活的锤炼，使学生能够具备良好的综合素质和应对社会变化、职业变化的基本能力，在人生的道路中跃上一个新的发展平台。
