黑龙江大学软件学院是经黑龙江省教育厅批准于2002年成立。学院以现代教育理念为指导，以黑龙江大学综合教学资源为依托，充分利用学校计算机学科的优势，通过与国内外大学、著名软件企业的合作，采用产学研结合模式，面向软件产业和行业，培养实用型、复合型软件工程方面的专门人才。
该院下设软件工程专业，以本科教育为主体，同时兼顾研究生和继续教育。本科教育含通过高考录取的新生，学制4年；校内双学位、双专业在校生，学制2-4年；硕士研究生教育分为软件专业硕士研究生、软件工程硕士研究生和与国外联合培养软件工程硕士研究生三类，修业年限为2-3年。
该院既注重学生基础理论培养，又面向工程来指导教学。学院将授课与实验课时之比调整为1:1，来加强实验环节；通过建立软件实践基地组织学生参与软件的实际研发和程序设计，来提高学生的软件设计研发能力；通过在软件企业中聘请一定数量的高级工程技术管理人员承担具有较强工程实践教学内容的教学任务，来提高学生的软件项目管理能力。目前，学院以黑龙江大学软件园作为教学实践基地。黑龙江大学软件园是省级软件开发和应用园区，现有十几家软件企业入驻。其中，中日合资伊思特信息技术有限公司、同庆软件工程股份有限公司、北软科技有限公司等企业的软件开发力量和技术实力雄厚，科技成果显著，成为软件学院办学的重要依托。随着软件学院的发展壮大，学院还将逐步与北京、上海、大连等地的知名软件企业建立合作关系，为学生的实践和就业提供帮助。