昆明植物园始建于1938年，是一个集科研、科普、旅游和教学实习为一体、具有明显区域特色的多
功能综合性植物园，是我国西南地区最大的亚热带植物多样性及种质资源保存研究基地和山茶、木兰、秋海棠等植物的引种栽培中心。昆明植物园由原来的植物园和植物生物技术研究室整合而成。2000年，又通过国际合作和院省合作，在丽江复建了丽江高山植物园和野外工作站。现有博士生导师5人，硕士生导师9人。
其科技目标是：以中国西部丰富的野生花卉资源（包括观赏、药用和香料等）和市场主流花卉品种为研究对象，运用生理生态学、分子生物学、遗传学、发育生物学以及相关生物技术手段，对野生花卉资源的开发和持续利用，对市场主流花卉产前、产中、产后各环节涉及到的基础及应用基础理论进行研究。
主要研究方向为：1）云南野生花卉资源的引种保存和选育种研究；2）珍稀濒危植物保护生物
学研究；3）药用植物种质资源的引种保存和抗逆性遗传资源的评估及筛选研究；4）植物生理生态学研究；5）极端环境下植物生命过程的分子机理的研究。
具体研究内容主要有：1）野生花卉资源的调查、引种栽培和繁殖技术研究；2）花卉遗传多样性、新品种选育和品种产权保护技术；3）野生花卉驯化适应性的分子机制及其应用；5）花卉引种驯化的生理生态适应基础；6）花卉采后细胞凋亡的分子生理与保鲜技术；7）次生代谢产物调控与花卉品种改良；8）珍稀濒危植物的野外调查和种质资源保存；9）濒危植物的生殖生物学研究；10）濒危植物种群结构与动态的研究；11）药用植物资源的引种保存和抗逆性遗传资源的评估及筛选研究；12）极端环境下植物生命过程的分子机理研究等。
拥有６０多年历史的昆明植物园总面积４４公顷，是一个以引种云南名贵花卉、云南中草药、云南重要树木和云南珍稀濒危植物为主要内容的活植物收集园。现已收集植物近４０００种，设有１０个专类植物园。
一、茶花园
茶花园占地150余亩，为我国最大的茶花专类园，共引种栽培了云南山茶、华东山茶、金花茶、茶梅等200多个品种15000多株。茶花园分为云南山茶品种区、华东山茶品种区和茶花生态区三部分，从1992年2月成功举办"中国第二届茶花展览"至今，已连续9年举办"云南山茶花展览"。"鸣凤山茶"已成为昆明新十六景之一。
二、杜鹃园
杜鹃园占地60亩，共引种栽培了云南产各种杜鹃花近百种，10000余株。全园分为映山红与锦绣杜鹃区、马缨花区、露珠杜鹃区、常绿杜鹃区以及烨煌园。杜鹃课题组开展了中海拔杜鹃的引种实验，杜鹃园已成为另一个具有广泛影响的专类花园。
三、温室区
温室花卉区占地30亩，其中温室建筑面积约3000平方米，分为中心温室（包括兰花馆、观叶植物馆、花卉馆）、秋海棠馆、热带植物馆、棕榈馆、仙人掌及多肉植物馆。温室花卉课题组深入到西双版纳、广西、广东、福建等地引种了各类温室植物和室内、室外观赏植物近千种。
四、树木园
树木园占地150亩，包括木兰园、蔷薇园、竹类区和珍、稀、濒危植物区等，其中木兰园共引种栽培了云南产的山玉兰、麻栗坡含笑、红花木莲、滇藏木兰等木兰科植物60余种。
五、蕨类园
蕨类植物园占地50余亩，共引种栽培了云南的桫椤、凤尾蕨、大理碎米蕨、毛兰铁线蕨、光叶凤丫蕨、大羽短肠蕨、毛蕨、尖叶铁角蕨等蕨类植物400余种，全园分为蕨类品种区和蕨类生态区两部分。
另外，兰圃占地面积15亩，共引种栽培了云南兰科植物150种。
园内有一条银杏和枫树组成的林荫大道，每到深秋时节，黄叶飘飞、红枫似火，景色令人陶醉。