吕本元(？——一九一O年)，字道生，安徽滁州人，行伍出身，初隶李鸿章淮军，参与镇压太平军、捻军起义，在苏、院、鲁、豫各省作战。以功晋总兵，赐号强勇巴图鲁，后随李鸿章入直隶。光绪初年，授四川重庆镇总兵，仍留统盛军马步各营。
一八九四年八月，甲午战争爆发，檄吕本元率兵出关，兼程至朝鲜安州。九月十五日，平壤失守，从宋庆退保鸭绿江防线。时盛军统领卫汝贵因在平壤战役临敌溃退，被“撤去统领，听候查办”，所部盛军归吕本元、孙显寅会统，防守安东县、沙河镇一线。十月二十五日，日军第一军司令官山县有朋指挥主力进攻清军鸭绿江防线九连城、虎山阵地前，于二十四日别遣佐藤正大佐率第十八联队由朝鲜水口镇涉水渡江，攻占安平河口，击退黑龙江齐字练军倭恒额部。宋庆派吕本元马队星夜驰援。二十五日，日军大队进攻虎山，吕本元又率队接应。及虎山失守，吕本元、孙显寅又率盛军从宋庆退往凤凰城。不久，宋庆回援金州、旅顺，留吕本元守连山关、甜水站，与聂士成、孙显寅等扼摩天岭通道，阻止日军由东路进犯辽沈。十一月十二日，日军第十旅团一部进犯连山关口，吕本元战败，连山关失守。二十五日，在聂士成支
援下重新收复连山关。次日，吕本元、聂士成、依克唐阿等部在草河岭与日军展开激战，击毙日军步兵大尉斋藤正起。击伤炮兵大尉池田纲平等。一八九五年一月十一日，为配合西路清军依克唐阿、长颁等反攻海城，吕本元、聂士成、孙显寅等由摩天岭、连山关主动出击，经通远堡进攻雪里站日军。日军人少，坚匿不出。此后，由于凤凰城、九连城一线日军陆续西调援海城，东线兵力日减。东边道一线遂无大战事。
甲午战争结束后，率兵退回宜隶。一九OO年义和团运动爆发，署天津镇总兵，不久理直隶提督，统淮、练各军，残酷镇压义和团运动，受弹伤。因镇压义和团有功，赏穿黄马褂。后调浙江。宣统二年(一九一O年)因病乞罢。寻卒。
