中国中医研究院商洛中药材GAP（Good Agriculture Practice）科研工程中心于2004年8月30日正式在商洛师专挂牌成立，该中心是由中国中医研究院和商洛市人民政府主办，以商洛师专为依托并联合西北农林科技大学、陕西师范大学、西北大学、商洛市农科所、陕西天士力植物药业有限公司、陕西香菊制药有限公司等其它省内和市内有关医药企业、科研院所共同组建的科研开发实体，是中国中医研究院在全国建立的第一个中药材GAP科研工程中心。中心以GAP研究与开发为重点，主要对商洛大宗、道地中药材资源进行普查、品种选育、环境监测、优种快繁、规范化栽培、病虫害防治、SOP制订、指纹图谱建立、质量控制以及储藏与加工等各方面进行研究与开发，全方位为商洛中药材规范化栽培、GAP基地认证、药材认证和中药饮片认证提供技术支撑，并充分利用产、学、研相结合的优势，不断增强中心研发、推广及创新能力，为秦巴山区中药现代化搭建技术平台。
中心科研力量雄厚，现有专业技术研究人员20余人，其中高级职称3人，研究生2人，执业药师2人，中药高级制剂工2人，同时联合中国中医研究院、西北农林科技大学、西北大学、陕西师范大学、陕西中医学院及陕西天士力植物药业有限公司等科研院所共同组建了GAP工程中心学术委员会，由中国中医研究院中药研究所所长、博士生导师黄璐琦研究员任主任，有研究员10人，均具有高级职称。中心拥有GAP研究与开发相关的实验设备30余台（件）；另建有组培室、日光大棚、苗圃多个，建有陕南最大的中药材饮片标本室。目前正承担着国家中药材规范化种植基地（商洛）建设项目2个，相关中药材50余种，计划建立10种中药材规范化种植示范基地1万亩，承担商洛市所有中药材规范化种植基地的技术指导工作。
