圣若望一世是意大利托斯卡人，青年时弃俗修道，历任教会要职。公元523年，当选教宗。
30年以来，岳特人统治意国，岳特王狄奥多，信奉亚略派异端。最初，他对正统教会，采取宽大政策；但是过了一个时期，他却采用严厉办法迫害教徒。为了整个教会的利益，教宗决定亲往君士坦丁堡，与东罗马皇帝儒斯定二世磋商。他到了君士坦丁堡，全城居民夹道相迎，儒斯定招待。耶稣复活节，教宗在东罗马首都大堂举行隆重的大礼弥撒。
教宗回到意大利，狄奥多怀疑他反对自己，捏造叛国罪名设计将他逮捕，囚禁在拉温那监狱，饱受苦辱，不久即死于狱中，遗体迎回罗马，葬在圣伯多禄大堂内。