职能机构是指法人总部设立的执行法人一部分职能的机构，常见的有企业法人的科（室）、车间等，如财务部、研发部、公关部等。
职能机构，是国家行政机关为了具体地组织和管理属于自己职权范围内某一方面的业务或事务而设立的相应的各种工作部门。