日本小说家谷川流的获奖小说，曾获得第八届Sneaker大赏（著名的《圣魔之血》小说原作者吉田直，也获得过这个奖项。）《凉宫春日》系列小说的第4部作品。
故事梗概
长门有希利用凉宫春日的力量创造了新世界（据长门本人说这是BUG），在长门创造的世界中SOS团成员变成了普通人并且所有人的记忆被篡改,只有阿虚被保留了记忆(长门想让阿虚做选择)。这个世界中春日和一树并没在北高而在山下的一座私立高中，长门变成普通爱书少女并且性格发生了微妙的改变，朝比奈实玖瑠只是普通学姐，朝仓凉子重新出现。发现世界改变的阿虚找到了长门留下的线索想将世界变回原样。阿虚通过约翰．史密斯（阿虚在《竹叶狂想曲》的时光旅行中，回到三年前的七夕接触春日时使用的假名，因此春日在后来真正初次和阿虚见面的时候就对他隐约有所印象，但之后春日始终不知道阿虚就是约翰史密斯。）这个名字让不认识自己的春日相信自己从而找到了钥匙（当所有原SOS团成员聚集在社团教室时）。之后启动了紧急逃脱模式前往未被影响的三年前的七夕在原来的长门和朝比奈（大）的帮助下回到世界刚刚改变的时候阻止长门，却遇到朝仓的袭击，阿虚被刺倒地。从未来来的另一个阿虚，朝比奈（小），正常的长门成功的完成将世界变回的工作。现实世界中的阿虚则从楼梯上摔下昏迷三天。
在此前《凉宫春日的忧郁2009》完结当晚公布了「凉宫春日的消失」剧场动画版2010年春公开的消息，预计将是以剧场版型式出品「凉宫春日的消失」动画版。
