日本金银纪念币的发行必须得到日本国会的批准。财政部负责协调造币厂发行金银币以及流通币。日本很少发行金银纪念币。1999年只发行了一枚纪念明仁天皇登基10周年纪念金币和一枚铜镍币。除了以上纪念币外，日本造币局于1999年还发行了11种流通币和3种精装流通币，面额有1～500日元6种，并用不同的包装形式。由于造币厂可以自行决定发行这些流通套币和精装流通套币，不用通过国会批准，所以，造币厂宁愿把精力放在这些币的装帧发行上。
新的铸币法为纪念币的面额作了规定，面额有1000、5000和10000日元。
日本纪念币最大的面额是1986年为纪念裕仁天皇登基60周年发行的纪念金币，面额100000日元（约1000美元）。日本造币局正在研究2002年世界杯足球赛纪念币发行事宜。