2006年9月26日，安倍晋三在众参两院指名选举中均获得过半数选票，当选第90任日本首相。下午，安倍晋三组建了新一届内阁。
官房长官：盐崎恭久
外务大臣：麻生太郎
防卫厅长官：久间章生(2007年1月9日，根据此前日本国会众参两院批准的法案，日本防卫厅升格为防卫省，防卫厅长官升格为防卫相。2007年6月30日，久间章生发表美国向日本投放原子弹是“无奈之举”的言论，7月3日被迫辞职)小池百合子(7月4日就任)
财务大臣：尾身幸次
文部科学大臣：伊吹文明
厚生劳动大臣：柳泽伯夫
农林水产大臣：松冈利胜(2007年5月28日，松冈利胜在东京自缢身亡)若林正俊(5月28日—6月1日临时代理)赤城德彦(6月1日—8月1日)若林正俊(8月1日兼任)
经济产业大臣：甘利明
经济财政担当大臣：大田弘子
总务兼邮政民营化担当大臣：菅义伟
法务大臣：长势甚远
国土交通兼观光立国担当大臣：冬柴铁三
环境大臣：若林正俊
国家公安委员会委员长兼防灾担当大臣：沟手显正
金融再挑战担当大臣：山本有二
冲绳、北方、技术革新、少子化及男女共同参与、食品安全担当大臣：高市早苗
规制改革、地区振兴、国家地方改革及道州制担当大臣：佐田玄一郎(2006年12月27日，佐田玄一郎因政治资金丑闻宣布辞职)渡边喜美(2006年12月28日就任)
2007年8月27日安倍晋三改组内阁。
总务相·纠正地方与都市差距担当相：增田宽也
法务相：鸠山邦夫
外务相：町村信孝
财务相：额贺福志郎
文部科学相：伊吹文明
厚生劳动相：舛添要一
农林水产相：远藤武彦(9月3日被曝曾不合法地收受政治献金，被迫辞职)若林正俊(9月3日就任)
经济产业相：甘利明
国土交通相：冬柴铁三
环境相：鸭下一郎
防卫相：高村正彦
官房长官·绑架问题担当相：与谢野馨
国家公安委员长·防灾担当相：泉信也
冲绳北方·再挑战担当相：岸田文雄
金融·行政改革担当相：渡边喜美
经济财政担当相：大田弘子
少子化担当相：上川阳子
安倍晋三9月12日在首相官邸会见记者时宣布辞职。
安倍晋三9月25日上午接受内阁大臣辞呈，随后宣布内阁总辞职。
