在阜成门外北京市委党校宽大的绿色庭院中央，有一座小小的墓园，四周被透花砖墙环绕着，南墙正中有两扇灰色铁花棂门，墓园中植几株青翠的柏树。这就是已有400多年历史的利玛窦墓。
墓园里并排竖立着三通汉白玉石碑，墓碑的形制与常见的一样，只是碑额雕龙花纹的中心，镌有代表天主教会的十字徽记，表明墓主是一位虔诚的天主教徒。中间的那一通螭首方座碑高2.7米、宽0.94米，为明万历三十八年(1610年)立。碑身正中刻有“耶稣会士利公之墓”八个大字。右边碑文是:“利先生讳玛窦，号西泰，大西洋意大利亚国人。自幼入会真修，明万历壬辛年航海首入中华衍教，万历庚子年来都，万历庚戌年卒。在世五十九年，在会四十二年。”石碑后面是灰身黑顶圆拱式的长方形砖砌坟墓，墓高1.5米、长2.4米、宽1.3米。利玛窦墓东侧为南怀仁墓，西侧为汤若望墓。这座耶稣会传教士的坟墓，建在宣传马克思主义无神论的党校校园里，是颇令人回味的。原来，在五十年代修建党校的高耸楼群时，有意将利玛窦墓保存下来，并圈以砖墙，广种花木，使这里由荒凉的旷野变成叶绿花繁的幽静庭院，使许多人可以来墓园参观凭吊，这正说明中国共产党是历史唯物主义者，尊重人们的宗教信仰，对那些为发展中国人民和各国人民的友谊做出贡献的人是不会忘记的。北京市人民政府还把“利玛窦墓及明清以来外国传教士墓地”确定为市级文物保护单位。
利玛窦在1610年(万历三十八年庚戌)5月11日病逝于北京，享年59岁。按照当时中国的惯例，外国人死后都要移葬澳门。但是中国的教友为了纪念利玛窦，上奏朝廷，申请赐地，下葬北京。明神宗万历皇帝破例准奏，亲赐葬地和安葬祀费，赐北京西郊“二里沟佛寺，房屋三十八间，地基二十亩，畀葬利子”“立石为文记之”(见《大西利先生行迹》)，墓碑是由顺天府尹王应麟所立。这年10月下葬时，朝廷的文武百官都参加了葬礼，非常庄严隆重。当时一位太监对于独给利玛窦葬地，曾问相国叶文忠:“诸远方来宾者，从古皆无赐葬，何独厚于利子?”叶答:“子见从古来宾，其道德学问，有一如利子者乎?姑无论其它事，即译《几何原本》一书，便宜赐葬地矣。”关于安葬时的墓地情况，《帝京景物略》有概略的记述:“玛窦卒，诏以陪臣礼葬阜成门外二里，嘉兴观之右。其坎封也，异中国，封下方而上圜，方若台圯，圜若断木。后虚堂六角，所供纵横十字文。后缘不琱篆而旋纹。……墓前堂二重，祀其国之圣贤。堂前晷石，有铭焉，曰:‘美日寸影，勿尔空过，所见万品，与时并流。’”谭元春有《过利西泰墓》一诗:“来从绝域老长安，分得城西土一棺。斫地呼天心自苦，挟山超海事非难。私将礼乐攻人短，别有聪明用物残。行尽松楸中国大，不教奇骨任荒寒。”后来还出现了一首写利玛窦的竹枝词:“天主堂开天籁齐，钟鸣琴响自高低。阜成门外玫瑰发，杯酒还浇利泰西。”
如今的利玛窦墓，依然保留着四百多年前大致的模样，但王应麟碑早已不见踪影，墓前的螭首方座碑是后来补立的，《帝京景物略》中记述的景物也面目全非了。利玛窦作为“西学东渐”的先行者，对中西文化交流作出了很大的贡献，中国人民将永远怀念他。
