法国巴斯德研究所成立于1887年，是一个公益型私人基金会。其职能是致力于对疾病的预防和治疗的科学研究、培训和其它公共卫生行为。它既是生物学基础性研究中心、大学后教学中心（研究与诊断培训），又是专门的生物医学中心、传染病专科住院中心、热带病理学和免疫系统疾病中心。巴斯德研究所包括一个历史展馆、一个科学展馆和一个新建的以图书馆为主体的科学信息中心。
巴斯德研究所在巴黎共有人员2500名。2003年度预算额为1.687亿欧元，由三个部分组成，其中巴斯德研究所自创收入0.615亿欧元，占36.5%；接受资助0.509亿欧元，占30.1%；政府支持0.563亿欧元，占33.4%。
巴斯德研究所在世界各地拥有24个分所：一部分在法国本土和海外领地；其它分布在世界各地：克特迪瓦、中非、希腊、意大利、阿尔及利亚、突尼斯、摩洛哥、越南、俄罗斯、塞内加尔、马达加斯加、伊朗、柬埔寨、罗马尼亚、喀麦隆、玻利维亚和中国。2004年10月法国总统希拉克访华期间，主持了巴斯德研究所上海分院的揭牌仪式。
巴斯德研究所主要从事的工作如下：
1）生物基础研究，
2）生物医学和生物技术的应用，
3）教学中心
4）国家参考中心和国际卫生组织合作中心，
5）生物合同和许可证鉴定，
6）医院（在医院中往往附有国际疫苗中心）。
巴斯德研究所共有100个研究单位或称研究组，包括在10个部门中，它们是：
a）细菌学和真菌学；
b）生态学；
c）病毒学；
d）免疫学；
e）生物化学和分子遗传学；
f）分子生物学；
g）生理病理学；
h）生物技术；
i）艾滋病与反病毒；
j）普通医学。