1995年，四川农业大学李桂垣教授根据四川天全和大邑县发表的旋木雀天全亚种Certhia familiaris tianquanensis可提升为种，称四川旋木雀C.tianquanensis。
2000年，孙悦华，Jochen Martens 在四川省洪雅县瓦屋山顶发现了李桂垣所描述的这种旋木雀，通过形态比较、鸣声分析和DNA鉴定，认定其为一个独立的物种——四川旋木雀（Certhia tianquanensis, Li）。
2004年，Paul Holt （英国）在陕西秦岭太白山录到了类似四川旋木雀的叫声，并给德国鸟类学家J. Martens寄送了相关录音。2005年5月6~15日，孙悦华，Jochen Martens 通过录音回放和捕捉辨认，发现四川旋木雀在秦岭确实有分布。在太白山发现四川旋木雀的林型以巴山冷(Abies fargesii)-糙皮桦(Betula utilis)为主，海拔为2600～2800 m，GPS为N34°01′,E107°48′。在洋县长青自然保护区发现四川旋木雀的林型以巴山冷杉-红桦(B. albo-sinensis)为主，海拔为2550～2700 m， GPS为N33°42′,E107°36′。在以上发现四川旋木雀的地方，皆有普通旋木雀同域分布。
