恩斯廷系在1485年维丁王朝分家後，继承了萨克森选帝侯之位和王朝在图林根的领地。在宗教战争期间，该分支逐渐倾向支持基督新教。最终，在1547年，萨克森选帝侯的职位和领地，被当时的神圣罗马皇帝卡尔五世改封予阿贝丁系。
早期恩斯廷系诸邦国
被废黜选侯之位的约翰·腓特烈一世得到了魏玛作为领地。于是他以魏玛为大本营，发展了他家族的力量。约翰·腓特烈一世于1554年去世，他的两个儿子瓜分了他的土地：长子约翰·腓特烈二世成为萨克森-科堡-艾森纳赫公爵，次子约翰·威廉成为萨克森-魏玛公爵。约翰·腓特烈二世死后土地又被两个儿子瓜分，但两个儿子都没有子嗣，领地为约翰·威廉的后代所有。
同样，约翰·威廉的孙子们也瓜分了他的土地：约翰·菲力普得到了他父亲于1573年分得的阿尔滕堡，他没有子嗣，萨克森-阿尔滕堡被他的弟弟约翰·威廉二世继承；“伟大的”威廉在1605年继承了他没有子嗣的哥哥的土地魏玛，并把他的王朝一直延续1918年德意志帝国灭亡；阿尔布雷希特得到了艾森纳赫，但没有子嗣的他去世后把土地给了“伟大的”威廉的小儿子；子嗣最多的“虔诚的”恩斯特得到了最广大的领地，开创了萨克森-哥达公国，他在去世的第五年，即1680年，7个儿子瓜分了他的土地，后来发展为萨克森-哥达-阿尔滕堡、萨克森-迈宁根、萨克森-希尔德伯格豪森、萨克森-科堡-萨费尔德等诸多邦国。
19世纪的恩斯廷系诸邦国
维也纳和会后，萨克森-魏玛-艾森纳赫升为大公国，萨克森-哥达-阿尔滕堡、萨克森-迈宁根、萨克森-希尔德伯格豪森、萨克森-科堡-萨费尔德成为德意志邦联下的独立公国，图林根地区成为了德意志王侯的集散地。1817年，萨克森-科堡-萨费尔德公爵恩斯特一世娶了萨克森-哥达-阿尔滕堡公爵奥古斯特的独生女路易丝。1825年，奥古斯特的弟弟腓特烈四世去世，萨克森-哥达-阿尔滕堡男系灭绝，恩斯廷系诸邦国最后一次重新划分：萨克森-科堡-萨费尔德公爵恩斯特一世得到了哥达并更名萨克森-科堡-哥达；希尔德伯格豪森为萨克森-迈宁根公爵博恩哈德二世所有；作为交换萨克森-希尔德伯格豪森公爵腓特烈得到阿尔滕堡，改称萨克森-阿尔滕堡公爵。
一战后的恩斯廷系诸邦国
1918年，德意志帝国灭亡，仅存的恩斯廷系诸邦国的四位君主都被推翻。萨克森-魏玛-艾森纳赫末代大公威廉·恩斯特于11月9日被迫退位；萨克森-迈宁根末代公爵博恩哈德三世在第二天被废；11月13日，萨克森-阿尔滕堡的恩斯特二世步了远方堂兄弟们的后尘；11月18日，萨克森-科堡-哥达公爵卡尔·爱德华被工人士兵国会废黜。