软件登记按照《计算机软件保护条例》的规定，软件登记机构发放的登记证明文件是登记事项的初步证明。同时软件著作权可以在发生著作权纠纷时，作为一种有力的证据。目前，软件著作权登记证书已经成为司法、科技、税收、金融、软件产品和软件企业认定等诸多领域广泛使用的知识产权证明文件。
一、申请软件著作权登记的，应当提交以下材料：
（一）按要求填写的软件著作权登记申请表；
（二）软件的鉴别材料（程序和文档的鉴别材料）；
（三）相关的证明文件，申请软件著作权登记的，应当提交以下主要证明文件：
1、自然人、法人或者其他组织的身份证明；
2、有著作权归属书面合同或者项目任务书的，应当提交合同或者项目任务书；
3、经原著作权人许可，在原有软件上开发的软件，应当提交原著作权人的许可证明；
4、权利继承人、受让人或者承受人，提交权利继承、受让或者承受的证明。
二、申请软件著作权登记的，可以选择以下方式之一对鉴别材料作例外交存：
（一）源程序的前、后各连续的30页；
（二）源程序连续的前10页，加上源程序的任何部分的连续的50页；
（三）目标程序的前、后各连续的30页，加上源程序的任何部分的连续的20页。
三、申请须知
1、办理软件登记申请应当以书面的方式提交必要的申请文件，并按规定缴纳费用。
2、申请文件都应当按规定签章，签章应当与申请表中填写的姓名或者名称完全一致。
3、申请人提交的证明文件是外文的，应当附有中文译本。申请所需提交的证明文件应当使用原件或副本，无法提交原件的，应当在提交的复印件上注明“与原件一致”，并加盖申请人的签章。
4、申请文件应当使用A4纸张，纵向、单面使用，文字应当从左向右排列。申请文件各部分应当分别用数字顺序在右上角标注页码。
5、申请文件是邮寄的，应当使用挂号信函或特快专递邮寄。
6、申请人可以自己办理登记，也可以委托代理机构办理登记。
7、申请人应当将所提交的申请文件留存一份，便于在补正程序中保持文件内容的一致。
四、办理登记步骤
1、办理流程
填写申请表--→提交申请文件--→缴纳申请费--→登记机构受理申请--→补正申请文件（非必须程序）--→取得登记证书
2、填写申请表
在中心网站上，首先进行用户注册，然后用户登陆，在线按要求填写申请表后，确认、提交并打印。
3、提交申请文件
申请人或代理人按照要求提交登记申请文件。
4、缴纳申请费
申请文件符合受理要求时，软件登记机构发出缴费通知，申请人或代理人按照通知要求缴纳费用。
5、登记机构受理申请
申请文件符合受理要求并缴纳申请费的，登记机构在规定的期限内予以受理，并向申请人或代理人发出受理通知书及缴费票据。
6、补正程序
申请文件存在缺陷的，申请人或代理人应在规定期限内补正，逾期不补正的，申请将被视为撤回；经补正仍不符合登记办法的，登记机构将不予登记并书面通知申请人或代理人。
7、获得登记证书
如到登记受理大厅领取证书，应当在受理之日起30个工作日后，持受理通知书原件领取证书。如需邮递的，请在申请表中填写正确的联系地址。