香港特别行政区政府的行政部门除了首长行政长官外，由以下各部份组成：
司长：负责制订主要政策或执行重要工作（如财政、法律）
政府总部：由所有决策局组成，是香港政府行政决策的总部，名义上首长是政务司司长
决策局（或称为政策局）：负责制订特定范畴政策（如运输、保安、卫生等）的行政单位，及监督属下部门的工作 。
部门：实际的执行部门
现时的成员如下
司长
政务司司长：许仕仁
财政司司长：唐英年
律政司司长：黄仁龙。虽然包括在问责制改革中，但律政司司长只负责法律事务，根据香港政府习惯不属于行政官员。
政府总部（决策局）
公务员事务局（局长：俞宗怡）
政制事务局（局长：林瑞麟）
教育统筹局（局长：李国章）
环境运输及工务局（局长：廖秀冬）
卫生福利及食物局（局长：周一岳）
民政事务局（局长：何志平）
房屋及规划地政局（局长：孙明扬）
保安局（局长：李少光）
工商及科技局（局长：王永平）
经济发展及劳工局（局长：叶澍堃）
财经事务及库务局（局长：马时亨）
“三司十一局”是司长及决策局的非正式统称。自前行政长官董建华于2002年7月1日实施问责制后开始被传媒使用。
部门
通常称为“署”（如卫生署）或“处”（如香港警务处），主管均为香港公务员，绝大部份向所属的决策局局长负责，小部分直接向司长负