巴林部为蒙古古老部落之一。其名称最早见于13世纪蒙古文名著《蒙古秘史》。到明初，明人用汉字音写的《秘史》译作巴阿邻。用波斯文撰写的14世纪名著《史集》通作Barin，汉译作八邻。
巴林部的源流可以上溯到公元10世纪。蒙古历史上的这个时期正是成吉思汗的第十世祖，孛儿只斤氏的创始人孛端察儿的时代。据一些可靠的史书记载，蒙古巴林部就是孛端察儿的后裔所繁衍。孛端察儿与其兄征服一群“无主”之百姓时，从中捉拿到札儿赤兀惕部的名叫兀良合真的妇女。《秘史》说：“那个妇女又跟孛端察儿生了一个儿子，因为是捉拿来的女人，就给那个儿子起名叫巴阿里歹，也就是巴阿邻氏族的祖先”（§41）。据《秘史》和《史集》的记载，巴林氏族可分四支：一曰巴阿邻；二曰蔑年巴阿邻；三曰你出古惕巴阿邻；四曰速客讷惕（Sugaina't）。
巴林部的祖先孛端察儿去世以后，他的子孙曾一度归属泰亦赤兀惕部。到了成吉思汗时代投靠了成吉思汗（《秘史》、《史集》），参预了汗统一蒙古建立蒙古国的活动，立下了丰功伟绩。从而成吉思汗将巴林部的三千户百姓由该部的诺颜“豁儿赤管辖，做万户，沿着额尔的思河林木中百姓之地，自由扎营居住”（《 秘史》§ 207）。从此大部分巴林人从东西迁，移到今阿尔泰山西北，额尔的失河上游。达延汗在位时代，巴林部在左翼三万户之一的喀尔喀万户名下，以其十二鄂托克之一而出现在历史舞台上。蒙古图们汗在位时代，巴林部苏巴海担任了汗庭五位执政大臣的要职，参预处理政务。明万历后势力衰落，明万历四十八年喀尔喀五部的28名诺颜以“刑白马乌牛誓盟”，向后金乞和，其中有巴林部。
天命十一年，后金以巴林叛盟，征之，戮其贝勒。天聪二年（1628年），巴林部为察哈尔所破，苏巴海之孙色特尔等率领巴林部投降后金。天聪八年（1634年），改封色特尔之子塞布腾郡王，主右翼，满朱习礼为贝子，主左翼，袭封。右翼、左翼同游牧地，当潢河（西拉沐沦河）北岸。东界阿噜科尔沁，南界翁牛特左翼，西界克什克腾，北界乌珠穆沁。
巴林部，在古北口外，至京师九百六十里。东西距二百五十一里，南北距二百三十三里。东阿噜科尔沁，西克什克腾，南翁牛特，北乌珠穆沁。斋元太元太祖十六世孙阿尔楚博罗特生和尔朔齐哈萨尔。子苏巴海，称达尔汉诺颜，号所部曰巴林。子巴噶巴图尔嗣。有子三：长额布格岱洪巴图鲁，次和托果尔昂哈，次色特尔。初皆服属于喀尔喀。古天命天命四年，额布格岱洪巴图鲁偕喀尔喀部长遣使乞盟，允之。十一年春，以背盟私与明和，大军往讨，阵斩台吉囊努克。冬，讨扎噜特，诏分军入部境以张兵势，焚原驱哨而还。会察哈尔林丹汗掠其诸部，台吉皆奔依科尔沁。天聪二年，色特尔率子色布腾及额布格岱洪巴图鲁子色棱、和托果尔昂哈子满珠习礼等，自科尔沁来归，优赉抚辑之。三年，从征明，由养息穆河入大安口，克遵化。四年，攻昌黎，与扎噜特兵围城北。六年，从略大同、宣府边。八年五月，会兵扎木哈克征察哈尔，赐宰桑布兑山津雕鞍良马，遂由独石口征明朔州，克堡八。十月，遣大臣赴硕翁科尔定诸籓牧，以扈拉瑚琥、呼布里都、克哩叶哈达、瑚济尔阿达克为巴林界。崇德元年，选兵从征明。三年，自墙子岭入明边，树云梯攻城，台吉阿玉什属索尔古先登，克之。四年，围锦州。六年，围松山。七年，献俘，赉将弁币。知顺治顺治元年，从入山海关，击流贼李自成。五年，诏编所部佐领，以满珠习礼掌左翼，爵固山贝子；色布腾掌右翼，爵多罗郡王：各授扎萨克。康熙二十三年，上幸塞外，驻跸乌拉岱，两翼扎萨克率诸台吉来朝，赐冠服、弓矢、银币有差。二十八年，诏发古北口仓粟赈所属贫户。二十九年，命额驸阿喇布坦率两翼兵四百，赴葫芦郭勒侦噶勒丹。是役也，色布腾子格哷尔图、纳木扎，孙纳木达克、桑哩达、乌尔衮，暨族台吉沙克塔尔等皆从。格哷尔图尤冲锋奋击，师旋，得优赉。三十四年，以噶勒丹掠喀尔喀至巴颜乌兰，诏檄敖汉、柰曼兵赴阿喇布坦军，并命纳木达克、乌尔衮等防乌珠穆沁汛。是年所部歉收，诏发坡赖屯米赈之。三十八年，命护军统领鄂克济哈、学士苏赫纳往会扎萨克等，将现贮巴林米千石散赈。若人众米寡，再运坡赖米赈给。雍正九年，随大军剿噶勒丹策凌。二等台吉璘瞻追贼察巴罕河，护驼马；又击之於塔尔勒图、固尔班什勒诸处。叙功，晋授一等台吉。知所部所部二旗：右翼驻托钵山，左翼驻阿察图拖罗海。爵四：亲王品级扎萨克多罗郡王一，扎萨克固山贝子一，附固山贝子二。光绪十七年，金丹道匪之变，贼渠李国珍扰至是部那林沟地，叶志超遣军击平之。三十三年，以是部垦地置林西县，隶赤峰直隶州。左翼有佐领十六，右翼有佐领二十六
