可分为单链（变性）和双链（天然）DNA抗体：
（1）抗单链DNA（ssDNA）抗体:在多种疾病中及正常人血清中存在，无特异性，临床价值不大。
（2）抗双链DNA（dsDNA抗体）：对诊断SLE有较高的特异性，且与SLE的活动相平行，并可作为治疗的估价。随着疾病活动的控制，抗dsDNA抗体滴度可以下降或消失。抗dsDNA抗体与DNA结合成为免疫复合物在肾小球基底膜沉积，或抗dsDNA抗体直接作用于肾小球抗原造成SLE患者的肾损害。抗dsDNA抗体阳性的患者较阴性患者发生肾炎的危险性高12倍。测定抗dsDNA抗体的方法很多，其中放射免疫法（Farr）敏感，用此法检测其结合率320％为 阳性，短膜虫或马疫锥虫为底物的间接免疫荧光法（IF－CT或IF－TE）更特异，此法31：5可判阳性。低滴度的抗DNA抗体也可在多种疾病甚至正常中人出现。