公元539年，宣化天皇即位，高丽之子苏我稻目被任命为大臣。与宣化朝同时，另有钦明天皇在位，因宣化绝嗣，540年由钦明天皇统一政权，苏我稻目继任大臣。他积极增设、经营朝廷的屯仓，主张尊奉佛教，甚至将私人宅邸改修为佛寺，其虔诚之心可见一斑。
苏我稻目在位期间，一直与当时同掌朝政的物部氏因争夺权利而敌对，552年10月发生的尊佛排佛事件，将苏、物两族敌对情绪推向高潮。
尚是佛教未曾传入日本之时，百济的圣明王派使节向大和国赠送了一尊佛祖释迦牟尼的金铜像和若干卷经论。天皇正为信仰犹豫不绝，以物部氏、中臣氏为首的一批朝臣主张置之不理，理由便是本土的一百八十神得罪不起，况且为何要无端地信奉外来之神明呢？苏我稻目却不以为然，他主张崇扬佛法，认为佛教既然能从天竺流传至百济，必有其可流传之处，此番佛之真谛，当物部氏未能明瞭。欣然自请将佛祖金铜像供奉在小垦国田家中，又把飞鸟向原的私宅改为佛寺，举家拜佛诵经。大抵是崇佛规模不够盛大，苏我氏出资广修寺院，佛教迅速在国中兴盛起来。少倾，却发生了一起不幸——苏我稻目崇佛的诚挚之心并未得到佛祖之恩赐，相反，无端地瘟疫横行，死者甚众，上下恐慌。物部氏掌权的大连尾舆趁机在年轻的天皇面前挑拨，说苏我氏崇外佛得罪了八百万诸神，继而领皇命将佛像投入难波的河流之中，又纵火焚烧伽蓝寺院，一时各地佛寺皆被查封，佛像被毁，苏我稻目痛心疾首，怨气抑郁难消。
555年春2月，百济圣明王遇害，其子惠王子赴日请求朝廷援助以雪父仇。苏我稻目以极度中庸之言辞向惠王子阐述了圣明王被害之根源，及保国长治久安之良策，希望百济人民祭祀创建国家的祖神，去祈祷，拯救将要灭亡的国主，方“国必安，人必静”，只要肯悔过前科，修理神宫，国家没有不繁荣昌盛的。
不久苏我稻目几次被外派，于555年在吉备五郡设白猪屯仓，556年秋7月在备前儿岛郡、冬10月在倭国高市郡等处，也分别设立了屯仓。
其后事件，直至570年春3月1日辞世，于《日本书纪》等处均未见记载。
