芽生细菌（budding bacteria）是以出芽方式繁殖的一群细菌。种类繁多。其母细胞在某一部位生出突起，逐渐膨大成为子细胞，最后与母细胞脱离或不脱离。在出芽过程中，母细胞保留原有的细胞壁，而子细胞则合成新壁。子细胞形成后，母细胞仍然存在。一般不运动，但脱离母细胞的新生子细胞常以鞭毛运动。
1898年，A．施图策尔和R．哈特勒布已经发现普通生丝微菌的芽生现象，但绝大部分芽生细菌是近20年发现的。有呈球状的（如浮霉状菌属），呈卵状或梨状的（如生丝单胞菌属），呈杆状的（如芽生杆菌属），呈螺杆状的（如谢利别氏菌属），还有生菌柄的（如臂微菌属）。
芽生细菌有的在母细胞表面直接出芽，如巴斯德氏芽菌属和芽生杆菌属；有的在母细胞生出的长丝状菌柄末端膨大成子细胞，如生丝微菌属和红微菌属；也有少数芽生细菌兼以二分分裂法进行繁殖，如谢利别氏菌属和红假单胞菌属。
大多数芽生细菌水栖，少数栖居在土壤中。
