耶路撒冷牧首，全称为耶路撒冷圣城和全巴勒斯坦牧首，是东正教15个自主教会之一耶路撒冷正教会的领袖。按照历史荣誉，耶路撒冷的牧首在所有正教领袖中列在第四位，仅次于君士坦丁堡牧首、亚历山大牧首和安提阿牧首。
在451年之前，耶路撒冷只是一个主教教区，在451年加尔西顿大公会议上被确立为宗主教教区的地位。按照传统说法，耶稣基督的弟兄雅各是耶路撒冷的第一位主教（62年）。
在阿拉伯人的征服之后，穆斯林统治者承认耶路撒冷作为基督教教区的地位，并且承认耶路撒冷宗主教（在东西教会大分裂之后，习惯上译为耶路撒冷牧首）是它的领袖。1099年攻占耶路撒冷的十字军流放了东正教教会的牧首，而指定了一个拉丁教会宗主教，企图将耶路撒冷教区拉丁化（或天主教化）。从此直到1187年耶路撒冷牧首都在君士坦丁堡避难。
今天，耶路撒冷牧首的圣座位于耶路撒冷的圣墓教堂。
现任耶路撒冷牧首是狄奥菲洛三世法座（2005年在前任牧首被废黜后当选）。
