九江市档案馆馆藏档案现有227个全宗，按历史时期和机构沿革划分为五部分即：民国档案、革命历史档案、原九江市档案（县级市）、现九江市档案（地市合并后）。截止2005年12月底，馆藏档案69660卷，排架长635.35米，资料13617册。馆藏检索工具有档案馆指南、全宗介绍、案卷目录、全引目录等，部分档案编有全宗卷， 机读检索目录文件级95254条案卷级58666条。档案最早形成时间为1921年资料最早形成时间为清朝。
民国档案 ：共15个全宗，4116卷。大体包括三个方面的档案：一是党团机构的档案；二是政府、军事、政法机构的档案；三是教育部门的档案。
革命历史档案：1个全宗，共102卷。主要是地方党史部门收集摘录的反映九江革命斗争情况的文件资料。
建国后档案：共211个全宗，65442卷，是九江市档案馆馆藏档案的主体，主要有1949年10月至1983年原九江地委、专署和原九江市委、市政府及各部委、办、局、群众团体及企事业单位的档案；1983年地市合并以后市委、市政府及市一级单位的档案。这些档案反映了九江社会主义革命和建设的发展历程及变化。