马仙琕（？－516），字灵馥，扶风郿县（今陕西眉县）人，南北朝时南梁著名将领，以勇武闻名。
年轻时，马仙琕应募从军，因每战争先，勇冠三军，被任命为郢州主簿，累以战功迁至豫州刺史，北魏著名将领王肃进攻寿阳，马仙琕奋勇力战，以少胜多，击败北魏军。萧衍起兵时，曾派苟仲宾邀其一同举事，但马仙琕斩了使节，同时派兵抄截萧衍军的粮道。直到建康陷落，才解兵归降。
天监四年（505），南梁大军北伐，马仙琕所向有功，为诸军之冠，被授予辅国将军之职，迁南义阳太守，封浛洭县伯。后，北魏豫州人白早生聚众降南梁，萧衍命马仙琕与直阁将军武会超、马广等人率兵救援，但部众仅有数千人，北魏中山王元英以大军十万包围，马仙琕力战不能取胜，败还。
天监十年（511），朐山（今江苏连云港）民众杀死北魏官吏，投降南梁，北魏政权派徐州刺史卢昶率大军十万进围朐山，萧衍授马仙琕为振武将军，假节，督诸军救援，马仙琕与卢昶战，屡破之，又断其粮道，卢昶不支，遁归，马仙琕追击，大获全胜，二百里间都是北魏军的尸体，缴获物资不计其数。凯旋后，因功被进爵为侯，迁豫州刺史，督豫、北豫、霍三州诸军事、信武将军、豫州刺史，领南汝阴太守。
马仙琕为将，能与士卒同甘苦，又每战争先，故所向克捷，516年在豫州病逝，谥号刚。
